Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7J1

PPP1R3E, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3E, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3EQ9H7J1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3EQ9H7J1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1R3EQ9H7J1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1R3EQ9H7J1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1R3EQ9H7J1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3EQ9H7J1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3EQ9H7J1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3EQ9H7J1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3EQ9H7J1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3EQ9H7J1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3EQ9H7J1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3EQ9H7J1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R3EQ9H7J1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3EQ9H7J1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3EQ9H7J1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3EQ9H7J1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R3EQ9H7J1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R3EQ9H7J1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R3EQ9H7J1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R3EQ9H7J1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R3EQ9H7J1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R3EQ9H7J1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3EQ9H7J1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3EQ9H7J1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3EQ9H7J1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3EQ9H7J1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3EQ9H7J1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3EQ9H7J1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3EQ9H7J1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3EQ9H7J1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3EQ9H7J1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3EQ9H7J1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3EQ9H7J1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3EQ9H7J1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R3EQ9H7J1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3EQ9H7J1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3EQ9H7J1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3EQ9H7J1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3EQ9H7J1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3EQ9H7J1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3EQ9H7J1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3EQ9H7J1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3EQ9H7J1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3EQ9H7J1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3EQ9H7J1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3EQ9H7J1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3EQ9H7J1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3EQ9H7J1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R3EQ9H7J1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R3EQ9H7J1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3EQ9H7J1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3EQ9H7J1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3EQ9H7J1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3EQ9H7J1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R3EQ9H7J1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1R3EQ9H7J1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R3EQ9H7J1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R3EQ9H7J1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R3EQ9H7J1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R3EQ9H7J1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R3EQ9H7J1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R3EQ9H7J1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R3EQ9H7J1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R3EQ9H7J1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R3EQ9H7J1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R3EQ9H7J1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP1R3EQ9H7J1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3EQ9H7J1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3EQ9H7J1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3EQ9H7J1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3EQ9H7J1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3EQ9H7J1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms