Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C8orf33Q9H7E9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C8orf33Q9H7E9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C8orf33Q9H7E9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C8orf33Q9H7E9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C8orf33Q9H7E9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C8orf33Q9H7E9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C8orf33Q9H7E9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C8orf33Q9H7E9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
C8orf33Q9H7E9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C8orf33Q9H7E9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C8orf33Q9H7E9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C8orf33Q9H7E9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C8orf33Q9H7E9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C8orf33Q9H7E9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C8orf33Q9H7E9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C8orf33Q9H7E9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C8orf33Q9H7E9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C8orf33Q9H7E9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C8orf33Q9H7E9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C8orf33Q9H7E9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C8orf33Q9H7E9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C8orf33Q9H7E9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C8orf33Q9H7E9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C8orf33Q9H7E9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C8orf33Q9H7E9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C8orf33Q9H7E9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C8orf33Q9H7E9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C8orf33Q9H7E9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C8orf33Q9H7E9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C8orf33Q9H7E9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C8orf33Q9H7E9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C8orf33Q9H7E9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C8orf33Q9H7E9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C8orf33Q9H7E9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C8orf33Q9H7E9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C8orf33Q9H7E9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C8orf33Q9H7E9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C8orf33Q9H7E9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C8orf33Q9H7E9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C8orf33Q9H7E9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
C8orf33Q9H7E9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
C8orf33Q9H7E9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C8orf33Q9H7E9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C8orf33Q9H7E9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C8orf33Q9H7E9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C8orf33Q9H7E9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C8orf33Q9H7E9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C8orf33Q9H7E9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C8orf33Q9H7E9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C8orf33Q9H7E9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C8orf33Q9H7E9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C8orf33Q9H7E9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C8orf33Q9H7E9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
C8orf33Q9H7E9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C8orf33Q9H7E9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C8orf33Q9H7E9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
C8orf33Q9H7E9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C8orf33Q9H7E9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C8orf33Q9H7E9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
C8orf33Q9H7E9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
C8orf33Q9H7E9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C8orf33Q9H7E9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C8orf33Q9H7E9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C8orf33Q9H7E9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
C8orf33Q9H7E9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C8orf33Q9H7E9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C8orf33Q9H7E9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
C8orf33Q9H7E9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf33Q9H7E9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C8orf33Q9H7E9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C8orf33Q9H7E9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C8orf33Q9H7E9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C8orf33Q9H7E9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C8orf33Q9H7E9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C8orf33Q9H7E9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C8orf33Q9H7E9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C8orf33Q9H7E9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C8orf33Q9H7E9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C8orf33Q9H7E9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C8orf33Q9H7E9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C8orf33Q9H7E9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
C8orf33Q9H7E9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C8orf33Q9H7E9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C8orf33Q9H7E9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C8orf33Q9H7E9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C8orf33Q9H7E9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C8orf33Q9H7E9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C8orf33Q9H7E9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C8orf33Q9H7E9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C8orf33Q9H7E9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
C8orf33Q9H7E9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C8orf33Q9H7E9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf33Q9H7E9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf33Q9H7E9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf33Q9H7E9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf33Q9H7E9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C8orf33Q9H7E9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C8orf33Q9H7E9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C8orf33Q9H7E9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms