Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC86Q9H6F5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC86Q9H6F5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC86Q9H6F5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC86Q9H6F5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC86Q9H6F5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC86Q9H6F5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC86Q9H6F5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC86Q9H6F5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC86Q9H6F5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC86Q9H6F5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC86Q9H6F5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC86Q9H6F5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC86Q9H6F5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC86Q9H6F5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC86Q9H6F5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC86Q9H6F5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC86Q9H6F5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC86Q9H6F5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC86Q9H6F5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC86Q9H6F5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC86Q9H6F5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC86Q9H6F5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC86Q9H6F5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC86Q9H6F5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC86Q9H6F5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC86Q9H6F5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC86Q9H6F5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC86Q9H6F5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC86Q9H6F5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC86Q9H6F5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC86Q9H6F5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC86Q9H6F5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC86Q9H6F5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC86Q9H6F5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC86Q9H6F5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC86Q9H6F5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC86Q9H6F5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC86Q9H6F5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC86Q9H6F5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC86Q9H6F5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC86Q9H6F5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC86Q9H6F5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC86Q9H6F5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC86Q9H6F5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC86Q9H6F5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC86Q9H6F5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC86Q9H6F5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC86Q9H6F5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC86Q9H6F5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC86Q9H6F5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC86Q9H6F5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC86Q9H6F5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC86Q9H6F5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC86Q9H6F5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC86Q9H6F5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC86Q9H6F5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC86Q9H6F5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC86Q9H6F5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC86Q9H6F5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC86Q9H6F5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC86Q9H6F5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC86Q9H6F5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC86Q9H6F5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC86Q9H6F5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC86Q9H6F5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC86Q9H6F5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC86Q9H6F5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC86Q9H6F5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC86Q9H6F5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC86Q9H6F5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC86Q9H6F5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC86Q9H6F5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC86Q9H6F5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC86Q9H6F5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC86Q9H6F5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC86Q9H6F5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC86Q9H6F5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC86Q9H6F5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC86Q9H6F5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC86Q9H6F5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC86Q9H6F5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC86Q9H6F5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC86Q9H6F5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC86Q9H6F5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC86Q9H6F5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC86Q9H6F5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC86Q9H6F5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC86Q9H6F5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC86Q9H6F5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC86Q9H6F5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC86Q9H6F5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC86Q9H6F5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC86Q9H6F5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC86Q9H6F5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC86Q9H6F5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC86Q9H6F5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC86Q9H6F5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC86Q9H6F5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC86Q9H6F5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms