Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PITPNM3Q9BZ71 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PITPNM3Q9BZ71 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PITPNM3Q9BZ71 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PITPNM3Q9BZ71 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PITPNM3Q9BZ71 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PITPNM3Q9BZ71 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PITPNM3Q9BZ71 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PITPNM3Q9BZ71 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PITPNM3Q9BZ71 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PITPNM3Q9BZ71 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PITPNM3Q9BZ71 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PITPNM3Q9BZ71 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PITPNM3Q9BZ71 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PITPNM3Q9BZ71 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PITPNM3Q9BZ71 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PITPNM3Q9BZ71 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PITPNM3Q9BZ71 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PITPNM3Q9BZ71 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PITPNM3Q9BZ71 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PITPNM3Q9BZ71 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PITPNM3Q9BZ71 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PITPNM3Q9BZ71 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PITPNM3Q9BZ71 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PITPNM3Q9BZ71 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PITPNM3Q9BZ71 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PITPNM3Q9BZ71 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PITPNM3Q9BZ71 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PITPNM3Q9BZ71 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PITPNM3Q9BZ71 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PITPNM3Q9BZ71 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PITPNM3Q9BZ71 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PITPNM3Q9BZ71 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PITPNM3Q9BZ71 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PITPNM3Q9BZ71 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PITPNM3Q9BZ71 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PITPNM3Q9BZ71 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PITPNM3Q9BZ71 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PITPNM3Q9BZ71 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PITPNM3Q9BZ71 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PITPNM3Q9BZ71 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PITPNM3Q9BZ71 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PITPNM3Q9BZ71 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PITPNM3Q9BZ71 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PITPNM3Q9BZ71 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PITPNM3Q9BZ71 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PITPNM3Q9BZ71 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PITPNM3Q9BZ71 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PITPNM3Q9BZ71 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PITPNM3Q9BZ71 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PITPNM3Q9BZ71 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PITPNM3Q9BZ71 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PITPNM3Q9BZ71 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PITPNM3Q9BZ71 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PITPNM3Q9BZ71 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PITPNM3Q9BZ71 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PITPNM3Q9BZ71 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PITPNM3Q9BZ71 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PITPNM3Q9BZ71 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PITPNM3Q9BZ71 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PITPNM3Q9BZ71 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PITPNM3Q9BZ71 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PITPNM3Q9BZ71 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PITPNM3Q9BZ71 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PITPNM3Q9BZ71 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PITPNM3Q9BZ71 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PITPNM3Q9BZ71 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PITPNM3Q9BZ71 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PITPNM3Q9BZ71 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PITPNM3Q9BZ71 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PITPNM3Q9BZ71 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PITPNM3Q9BZ71 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PITPNM3Q9BZ71 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PITPNM3Q9BZ71 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PITPNM3Q9BZ71 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PITPNM3Q9BZ71 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PITPNM3Q9BZ71 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PITPNM3Q9BZ71 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PITPNM3Q9BZ71 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PITPNM3Q9BZ71 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PITPNM3Q9BZ71 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PITPNM3Q9BZ71 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PITPNM3Q9BZ71 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PITPNM3Q9BZ71 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PITPNM3Q9BZ71 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PITPNM3Q9BZ71 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PITPNM3Q9BZ71 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms