Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PLVAPQ9BX97 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PLVAPQ9BX97 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PLVAPQ9BX97 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PLVAPQ9BX97 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PLVAPQ9BX97 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PLVAPQ9BX97 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PLVAPQ9BX97 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PLVAPQ9BX97 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PLVAPQ9BX97 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PLVAPQ9BX97 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLVAPQ9BX97 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLVAPQ9BX97 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLVAPQ9BX97 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PLVAPQ9BX97 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLVAPQ9BX97 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLVAPQ9BX97 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PLVAPQ9BX97 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PLVAPQ9BX97 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLVAPQ9BX97 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PLVAPQ9BX97 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PLVAPQ9BX97 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PLVAPQ9BX97 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLVAPQ9BX97 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLVAPQ9BX97 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLVAPQ9BX97 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PLVAPQ9BX97 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLVAPQ9BX97 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLVAPQ9BX97 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLVAPQ9BX97 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLVAPQ9BX97 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PLVAPQ9BX97 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLVAPQ9BX97 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PLVAPQ9BX97 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PLVAPQ9BX97 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PLVAPQ9BX97 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PLVAPQ9BX97 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PLVAPQ9BX97 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PLVAPQ9BX97 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PLVAPQ9BX97 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PLVAPQ9BX97 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PLVAPQ9BX97 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PLVAPQ9BX97 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PLVAPQ9BX97 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLVAPQ9BX97 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PLVAPQ9BX97 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PLVAPQ9BX97 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PLVAPQ9BX97 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLVAPQ9BX97 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PLVAPQ9BX97 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PLVAPQ9BX97 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PLVAPQ9BX97 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PLVAPQ9BX97 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PLVAPQ9BX97 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLVAPQ9BX97 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLVAPQ9BX97 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PLVAPQ9BX97 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PLVAPQ9BX97 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLVAPQ9BX97 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLVAPQ9BX97 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLVAPQ9BX97 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLVAPQ9BX97 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLVAPQ9BX97 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLVAPQ9BX97 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLVAPQ9BX97 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLVAPQ9BX97 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLVAPQ9BX97 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLVAPQ9BX97 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLVAPQ9BX97 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PLVAPQ9BX97 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PLVAPQ9BX97 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PLVAPQ9BX97 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLVAPQ9BX97 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLVAPQ9BX97 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLVAPQ9BX97 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PLVAPQ9BX97 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLVAPQ9BX97 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PLVAPQ9BX97 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PLVAPQ9BX97 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PLVAPQ9BX97 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLVAPQ9BX97 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLVAPQ9BX97 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLVAPQ9BX97 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PLVAPQ9BX97 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLVAPQ9BX97 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PLVAPQ9BX97 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PLVAPQ9BX97 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms