Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TMUB1Q9BVT8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMUB1Q9BVT8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMUB1Q9BVT8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMUB1Q9BVT8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMUB1Q9BVT8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMUB1Q9BVT8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMUB1Q9BVT8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMUB1Q9BVT8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMUB1Q9BVT8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMUB1Q9BVT8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMUB1Q9BVT8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMUB1Q9BVT8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMUB1Q9BVT8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMUB1Q9BVT8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMUB1Q9BVT8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMUB1Q9BVT8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMUB1Q9BVT8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMUB1Q9BVT8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMUB1Q9BVT8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMUB1Q9BVT8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMUB1Q9BVT8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMUB1Q9BVT8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMUB1Q9BVT8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMUB1Q9BVT8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMUB1Q9BVT8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMUB1Q9BVT8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMUB1Q9BVT8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMUB1Q9BVT8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMUB1Q9BVT8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMUB1Q9BVT8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMUB1Q9BVT8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMUB1Q9BVT8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMUB1Q9BVT8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMUB1Q9BVT8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMUB1Q9BVT8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMUB1Q9BVT8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMUB1Q9BVT8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMUB1Q9BVT8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMUB1Q9BVT8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMUB1Q9BVT8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMUB1Q9BVT8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMUB1Q9BVT8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMUB1Q9BVT8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMUB1Q9BVT8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMUB1Q9BVT8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMUB1Q9BVT8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMUB1Q9BVT8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMUB1Q9BVT8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMUB1Q9BVT8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMUB1Q9BVT8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMUB1Q9BVT8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMUB1Q9BVT8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMUB1Q9BVT8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMUB1Q9BVT8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMUB1Q9BVT8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMUB1Q9BVT8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMUB1Q9BVT8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMUB1Q9BVT8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMUB1Q9BVT8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMUB1Q9BVT8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMUB1Q9BVT8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMUB1Q9BVT8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMUB1Q9BVT8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMUB1Q9BVT8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMUB1Q9BVT8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMUB1Q9BVT8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMUB1Q9BVT8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMUB1Q9BVT8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMUB1Q9BVT8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMUB1Q9BVT8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMUB1Q9BVT8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMUB1Q9BVT8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMUB1Q9BVT8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMUB1Q9BVT8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMUB1Q9BVT8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMUB1Q9BVT8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMUB1Q9BVT8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMUB1Q9BVT8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMUB1Q9BVT8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMUB1Q9BVT8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMUB1Q9BVT8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMUB1Q9BVT8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMUB1Q9BVT8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMUB1Q9BVT8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMUB1Q9BVT8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMUB1Q9BVT8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms