Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf88Q9BSF0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf88Q9BSF0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf88Q9BSF0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf88Q9BSF0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf88Q9BSF0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf88Q9BSF0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf88Q9BSF0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf88Q9BSF0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf88Q9BSF0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C2orf88Q9BSF0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C2orf88Q9BSF0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C2orf88Q9BSF0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C2orf88Q9BSF0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C2orf88Q9BSF0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C2orf88Q9BSF0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C2orf88Q9BSF0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf88Q9BSF0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf88Q9BSF0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf88Q9BSF0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf88Q9BSF0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf88Q9BSF0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf88Q9BSF0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf88Q9BSF0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf88Q9BSF0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf88Q9BSF0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf88Q9BSF0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf88Q9BSF0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf88Q9BSF0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf88Q9BSF0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf88Q9BSF0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf88Q9BSF0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf88Q9BSF0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf88Q9BSF0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf88Q9BSF0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf88Q9BSF0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf88Q9BSF0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C2orf88Q9BSF0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms