Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPAS2Q99743 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPAS2Q99743 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPAS2Q99743 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPAS2Q99743 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPAS2Q99743 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NPAS2Q99743 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPAS2Q99743 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPAS2Q99743 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPAS2Q99743 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPAS2Q99743 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPAS2Q99743 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NPAS2Q99743 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPAS2Q99743 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPAS2Q99743 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPAS2Q99743 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPAS2Q99743 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NPAS2Q99743 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPAS2Q99743 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPAS2Q99743 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPAS2Q99743 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPAS2Q99743 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPAS2Q99743 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPAS2Q99743 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPAS2Q99743 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPAS2Q99743 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPAS2Q99743 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPAS2Q99743 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPAS2Q99743 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPAS2Q99743 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPAS2Q99743 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPAS2Q99743 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPAS2Q99743 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPAS2Q99743 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPAS2Q99743 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPAS2Q99743 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPAS2Q99743 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPAS2Q99743 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPAS2Q99743 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPAS2Q99743 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPAS2Q99743 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPAS2Q99743 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPAS2Q99743 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPAS2Q99743 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPAS2Q99743 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPAS2Q99743 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPAS2Q99743 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NPAS2Q99743 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPAS2Q99743 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPAS2Q99743 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPAS2Q99743 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPAS2Q99743 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPAS2Q99743 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPAS2Q99743 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPAS2Q99743 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPAS2Q99743 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPAS2Q99743 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPAS2Q99743 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPAS2Q99743 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPAS2Q99743 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPAS2Q99743 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPAS2Q99743 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPAS2Q99743 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NPAS2Q99743 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPAS2Q99743 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPAS2Q99743 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPAS2Q99743 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPAS2Q99743 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPAS2Q99743 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPAS2Q99743 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPAS2Q99743 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPAS2Q99743 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPAS2Q99743 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPAS2Q99743 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPAS2Q99743 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPAS2Q99743 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPAS2Q99743 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPAS2Q99743 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPAS2Q99743 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPAS2Q99743 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPAS2Q99743 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPAS2Q99743 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPAS2Q99743 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPAS2Q99743 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPAS2Q99743 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPAS2Q99743 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPAS2Q99743 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPAS2Q99743 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NPAS2Q99743 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPAS2Q99743 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPAS2Q99743 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPAS2Q99743 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPAS2Q99743 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPAS2Q99743 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPAS2Q99743 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NPAS2Q99743 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPAS2Q99743 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPAS2Q99743 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPAS2Q99743 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPAS2Q99743 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms