Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCNX1Q96RV3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX1Q96RV3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX1Q96RV3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNX1Q96RV3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX1Q96RV3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX1Q96RV3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX1Q96RV3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX1Q96RV3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX1Q96RV3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNX1Q96RV3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNX1Q96RV3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNX1Q96RV3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNX1Q96RV3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNX1Q96RV3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNX1Q96RV3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNX1Q96RV3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNX1Q96RV3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNX1Q96RV3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNX1Q96RV3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNX1Q96RV3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNX1Q96RV3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNX1Q96RV3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX1Q96RV3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX1Q96RV3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNX1Q96RV3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNX1Q96RV3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCNX1Q96RV3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX1Q96RV3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX1Q96RV3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX1Q96RV3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX1Q96RV3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX1Q96RV3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX1Q96RV3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX1Q96RV3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX1Q96RV3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNX1Q96RV3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PCNX1Q96RV3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCNX1Q96RV3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCNX1Q96RV3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCNX1Q96RV3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCNX1Q96RV3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCNX1Q96RV3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCNX1Q96RV3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCNX1Q96RV3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCNX1Q96RV3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNX1Q96RV3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX1Q96RV3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX1Q96RV3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX1Q96RV3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCNX1Q96RV3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCNX1Q96RV3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCNX1Q96RV3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCNX1Q96RV3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNX1Q96RV3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNX1Q96RV3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNX1Q96RV3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNX1Q96RV3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNX1Q96RV3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNX1Q96RV3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNX1Q96RV3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNX1Q96RV3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNX1Q96RV3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNX1Q96RV3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNX1Q96RV3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNX1Q96RV3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNX1Q96RV3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNX1Q96RV3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNX1Q96RV3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNX1Q96RV3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCNX1Q96RV3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCNX1Q96RV3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCNX1Q96RV3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNX1Q96RV3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNX1Q96RV3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNX1Q96RV3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNX1Q96RV3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNX1Q96RV3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNX1Q96RV3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNX1Q96RV3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX1Q96RV3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX1Q96RV3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX1Q96RV3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNX1Q96RV3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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