Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX18Q96RF0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX18Q96RF0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX18Q96RF0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX18Q96RF0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX18Q96RF0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX18Q96RF0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX18Q96RF0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX18Q96RF0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX18Q96RF0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX18Q96RF0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX18Q96RF0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX18Q96RF0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX18Q96RF0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX18Q96RF0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX18Q96RF0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX18Q96RF0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX18Q96RF0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX18Q96RF0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX18Q96RF0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX18Q96RF0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX18Q96RF0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX18Q96RF0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX18Q96RF0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX18Q96RF0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX18Q96RF0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX18Q96RF0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX18Q96RF0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX18Q96RF0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX18Q96RF0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX18Q96RF0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX18Q96RF0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX18Q96RF0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX18Q96RF0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX18Q96RF0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX18Q96RF0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX18Q96RF0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX18Q96RF0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX18Q96RF0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX18Q96RF0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX18Q96RF0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX18Q96RF0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX18Q96RF0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX18Q96RF0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX18Q96RF0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX18Q96RF0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX18Q96RF0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX18Q96RF0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX18Q96RF0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX18Q96RF0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX18Q96RF0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX18Q96RF0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX18Q96RF0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX18Q96RF0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX18Q96RF0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms