Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
ARAP1Q96P48 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC46.85■■■■■ 5.09
ARAP1Q96P48 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
ARAP1Q96P48 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
ARAP1Q96P48 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
ARAP1Q96P48 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC46.71■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC46.66■■■■■ 5.06
ARAP1Q96P48 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
ARAP1Q96P48 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
ARAP1Q96P48 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
ARAP1Q96P48 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC46.59■■■■■ 5.05
ARAP1Q96P48 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
ARAP1Q96P48 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.56■■■■■ 5.04
ARAP1Q96P48 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
ARAP1Q96P48 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC46.55■■■■■ 5.04
ARAP1Q96P48 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
ARAP1Q96P48 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC46.53■■■■■ 5.04
ARAP1Q96P48 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC46.51■■■■■ 5.04
ARAP1Q96P48 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
ARAP1Q96P48 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
ARAP1Q96P48 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC46.46■■■■■ 5.03
ARAP1Q96P48 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
ARAP1Q96P48 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
ARAP1Q96P48 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
ARAP1Q96P48 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC46.37■■■■■ 5.01
ARAP1Q96P48 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC46.37■■■■■ 5.01
ARAP1Q96P48 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
ARAP1Q96P48 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
ARAP1Q96P48 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
ARAP1Q96P48 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
ARAP1Q96P48 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
ARAP1Q96P48 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.31■■■■■ 5
ARAP1Q96P48 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
ARAP1Q96P48 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC46.29■■■■■ 5
ARAP1Q96P48 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
ARAP1Q96P48 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
ARAP1Q96P48 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
ARAP1Q96P48 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
ARAP1Q96P48 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
ARAP1Q96P48 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
ARAP1Q96P48 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC46.04■■■■■ 4.96
ARAP1Q96P48 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
ARAP1Q96P48 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
ARAP1Q96P48 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC46■■■■■ 4.95
ARAP1Q96P48 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46■■■■■ 4.95
ARAP1Q96P48 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
ARAP1Q96P48 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC45.95■■■■■ 4.95
ARAP1Q96P48 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC45.86■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC45.79■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC45.79■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC45.78■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
ARAP1Q96P48 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
ARAP1Q96P48 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
ARAP1Q96P48 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
ARAP1Q96P48 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
ARAP1Q96P48 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
ARAP1Q96P48 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
ARAP1Q96P48 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
ARAP1Q96P48 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
ARAP1Q96P48 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
ARAP1Q96P48 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
ARAP1Q96P48 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
ARAP1Q96P48 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
ARAP1Q96P48 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC45.59■■■■■ 4.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 543.7 ms