Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC49.04■■■■■ 5.44
ARAP1Q96P48 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
ARAP1Q96P48 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
ARAP1Q96P48 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
ARAP1Q96P48 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC48.9■■■■■ 5.42
ARAP1Q96P48 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC48.81■■■■■ 5.4
ARAP1Q96P48 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC48.8■■■■■ 5.4
ARAP1Q96P48 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC48.76■■■■■ 5.4
ARAP1Q96P48 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC48.67■■■■■ 5.38
ARAP1Q96P48 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
ARAP1Q96P48 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC48.59■■■■■ 5.37
ARAP1Q96P48 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
ARAP1Q96P48 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.48■■■■■ 5.35
ARAP1Q96P48 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC48.48■■■■■ 5.35
ARAP1Q96P48 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
ARAP1Q96P48 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
ARAP1Q96P48 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC48.39■■■■■ 5.34
ARAP1Q96P48 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
ARAP1Q96P48 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
ARAP1Q96P48 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
ARAP1Q96P48 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.29■■■■■ 5.32
ARAP1Q96P48 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC48.29■■■■■ 5.32
ARAP1Q96P48 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC48.28■■■■■ 5.32
ARAP1Q96P48 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC48.27■■■■■ 5.32
ARAP1Q96P48 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
ARAP1Q96P48 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
ARAP1Q96P48 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
ARAP1Q96P48 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
ARAP1Q96P48 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
ARAP1Q96P48 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC48.16■■■■■ 5.3
ARAP1Q96P48 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC48.12■■■■■ 5.29
ARAP1Q96P48 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.12■■■■■ 5.29
ARAP1Q96P48 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
ARAP1Q96P48 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
ARAP1Q96P48 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC48.03■■■■■ 5.28
ARAP1Q96P48 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC48.01■■■■■ 5.28
ARAP1Q96P48 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48■■■■■ 5.27
ARAP1Q96P48 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
ARAP1Q96P48 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
ARAP1Q96P48 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
ARAP1Q96P48 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.86■■■■■ 5.25
ARAP1Q96P48 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC47.86■■■■■ 5.25
ARAP1Q96P48 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
ARAP1Q96P48 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC47.84■■■■■ 5.25
ARAP1Q96P48 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC47.83■■■■■ 5.25
ARAP1Q96P48 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
ARAP1Q96P48 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC47.78■■■■■ 5.24
ARAP1Q96P48 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.78■■■■■ 5.24
ARAP1Q96P48 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
ARAP1Q96P48 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC47.72■■■■■ 5.23
ARAP1Q96P48 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
ARAP1Q96P48 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
ARAP1Q96P48 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.69■■■■■ 5.22
ARAP1Q96P48 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC47.68■■■■■ 5.22
ARAP1Q96P48 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
ARAP1Q96P48 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.68■■■■■ 5.22
ARAP1Q96P48 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC47.65■■■■■ 5.22
ARAP1Q96P48 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
ARAP1Q96P48 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC47.61■■■■■ 5.21
ARAP1Q96P48 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC47.57■■■■■ 5.21
ARAP1Q96P48 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC47.5■■■■■ 5.19
ARAP1Q96P48 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC47.46■■■■■ 5.19
ARAP1Q96P48 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
ARAP1Q96P48 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
ARAP1Q96P48 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC47.39■■■■■ 5.18
ARAP1Q96P48 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.17
ARAP1Q96P48 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC47.38■■■■■ 5.17
ARAP1Q96P48 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC47.38■■■■■ 5.17
ARAP1Q96P48 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC47.37■■■■■ 5.17
ARAP1Q96P48 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC47.36■■■■■ 5.17
ARAP1Q96P48 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.33■■■■■ 5.17
ARAP1Q96P48 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC47.29■■■■■ 5.16
ARAP1Q96P48 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
ARAP1Q96P48 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC47.28■■■■■ 5.16
ARAP1Q96P48 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
ARAP1Q96P48 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
ARAP1Q96P48 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
ARAP1Q96P48 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC47.21■■■■■ 5.15
ARAP1Q96P48 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
ARAP1Q96P48 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
ARAP1Q96P48 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
ARAP1Q96P48 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
ARAP1Q96P48 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
ARAP1Q96P48 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.13■■■■■ 5.13
ARAP1Q96P48 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
ARAP1Q96P48 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
ARAP1Q96P48 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC47.07■■■■■ 5.13
ARAP1Q96P48 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC47.03■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC47.01■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
ARAP1Q96P48 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
ARAP1Q96P48 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
ARAP1Q96P48 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
ARAP1Q96P48 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
ARAP1Q96P48 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC46.87■■■■■ 5.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms