Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM47Q96LD4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM47Q96LD4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM47Q96LD4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM47Q96LD4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM47Q96LD4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM47Q96LD4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM47Q96LD4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM47Q96LD4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM47Q96LD4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM47Q96LD4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM47Q96LD4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM47Q96LD4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM47Q96LD4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM47Q96LD4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM47Q96LD4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM47Q96LD4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRIM47Q96LD4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRIM47Q96LD4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM47Q96LD4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM47Q96LD4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM47Q96LD4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRIM47Q96LD4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRIM47Q96LD4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRIM47Q96LD4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
TRIM47Q96LD4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRIM47Q96LD4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRIM47Q96LD4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
TRIM47Q96LD4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TRIM47Q96LD4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRIM47Q96LD4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRIM47Q96LD4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRIM47Q96LD4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM47Q96LD4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM47Q96LD4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM47Q96LD4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM47Q96LD4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM47Q96LD4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM47Q96LD4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM47Q96LD4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM47Q96LD4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM47Q96LD4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM47Q96LD4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM47Q96LD4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM47Q96LD4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM47Q96LD4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM47Q96LD4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRIM47Q96LD4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TRIM47Q96LD4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRIM47Q96LD4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRIM47Q96LD4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRIM47Q96LD4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM47Q96LD4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM47Q96LD4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM47Q96LD4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM47Q96LD4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM47Q96LD4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM47Q96LD4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRIM47Q96LD4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM47Q96LD4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM47Q96LD4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM47Q96LD4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM47Q96LD4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM47Q96LD4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM47Q96LD4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRIM47Q96LD4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRIM47Q96LD4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRIM47Q96LD4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRIM47Q96LD4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRIM47Q96LD4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM47Q96LD4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM47Q96LD4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM47Q96LD4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM47Q96LD4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TRIM47Q96LD4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM47Q96LD4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM47Q96LD4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM47Q96LD4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM47Q96LD4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM47Q96LD4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM47Q96LD4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM47Q96LD4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM47Q96LD4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM47Q96LD4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM47Q96LD4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM47Q96LD4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRIM47Q96LD4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM47Q96LD4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM47Q96LD4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRIM47Q96LD4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRIM47Q96LD4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRIM47Q96LD4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms