Protein–RNA interactions for Protein: Q96L50

LRR1, Leucine-rich repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRR1Q96L50 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRR1Q96L50 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRR1Q96L50 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRR1Q96L50 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRR1Q96L50 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRR1Q96L50 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRR1Q96L50 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRR1Q96L50 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRR1Q96L50 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRR1Q96L50 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRR1Q96L50 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRR1Q96L50 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRR1Q96L50 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRR1Q96L50 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRR1Q96L50 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRR1Q96L50 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRR1Q96L50 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRR1Q96L50 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRR1Q96L50 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRR1Q96L50 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRR1Q96L50 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRR1Q96L50 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRR1Q96L50 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRR1Q96L50 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRR1Q96L50 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRR1Q96L50 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRR1Q96L50 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRR1Q96L50 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRR1Q96L50 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRR1Q96L50 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRR1Q96L50 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRR1Q96L50 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRR1Q96L50 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRR1Q96L50 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRR1Q96L50 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRR1Q96L50 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRR1Q96L50 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRR1Q96L50 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRR1Q96L50 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRR1Q96L50 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRR1Q96L50 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRR1Q96L50 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRR1Q96L50 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRR1Q96L50 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRR1Q96L50 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRR1Q96L50 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRR1Q96L50 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRR1Q96L50 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRR1Q96L50 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRR1Q96L50 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRR1Q96L50 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRR1Q96L50 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRR1Q96L50 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRR1Q96L50 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRR1Q96L50 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRR1Q96L50 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRR1Q96L50 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRR1Q96L50 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRR1Q96L50 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRR1Q96L50 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRR1Q96L50 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRR1Q96L50 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRR1Q96L50 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRR1Q96L50 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRR1Q96L50 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRR1Q96L50 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRR1Q96L50 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRR1Q96L50 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRR1Q96L50 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRR1Q96L50 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRR1Q96L50 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRR1Q96L50 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRR1Q96L50 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRR1Q96L50 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRR1Q96L50 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRR1Q96L50 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRR1Q96L50 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRR1Q96L50 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRR1Q96L50 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRR1Q96L50 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRR1Q96L50 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRR1Q96L50 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRR1Q96L50 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRR1Q96L50 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms