Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX8

PERP, p53 apoptosis effector related to PMP-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERPQ96FX8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PERPQ96FX8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PERPQ96FX8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PERPQ96FX8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PERPQ96FX8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PERPQ96FX8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PERPQ96FX8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PERPQ96FX8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PERPQ96FX8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PERPQ96FX8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PERPQ96FX8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PERPQ96FX8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PERPQ96FX8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PERPQ96FX8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PERPQ96FX8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PERPQ96FX8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PERPQ96FX8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PERPQ96FX8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PERPQ96FX8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PERPQ96FX8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PERPQ96FX8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PERPQ96FX8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PERPQ96FX8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PERPQ96FX8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PERPQ96FX8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PERPQ96FX8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PERPQ96FX8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PERPQ96FX8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PERPQ96FX8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PERPQ96FX8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PERPQ96FX8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PERPQ96FX8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PERPQ96FX8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PERPQ96FX8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PERPQ96FX8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PERPQ96FX8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PERPQ96FX8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PERPQ96FX8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PERPQ96FX8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PERPQ96FX8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PERPQ96FX8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PERPQ96FX8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PERPQ96FX8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PERPQ96FX8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PERPQ96FX8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PERPQ96FX8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PERPQ96FX8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PERPQ96FX8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PERPQ96FX8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PERPQ96FX8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PERPQ96FX8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PERPQ96FX8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PERPQ96FX8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PERPQ96FX8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PERPQ96FX8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PERPQ96FX8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PERPQ96FX8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PERPQ96FX8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PERPQ96FX8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PERPQ96FX8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PERPQ96FX8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PERPQ96FX8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PERPQ96FX8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PERPQ96FX8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PERPQ96FX8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PERPQ96FX8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PERPQ96FX8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PERPQ96FX8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PERPQ96FX8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PERPQ96FX8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PERPQ96FX8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PERPQ96FX8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PERPQ96FX8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PERPQ96FX8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PERPQ96FX8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PERPQ96FX8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PERPQ96FX8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PERPQ96FX8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PERPQ96FX8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PERPQ96FX8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PERPQ96FX8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PERPQ96FX8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PERPQ96FX8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PERPQ96FX8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PERPQ96FX8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PERPQ96FX8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PERPQ96FX8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms