Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS9Q8WXC6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS9Q8WXC6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS9Q8WXC6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS9Q8WXC6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS9Q8WXC6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS9Q8WXC6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS9Q8WXC6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS9Q8WXC6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS9Q8WXC6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS9Q8WXC6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS9Q8WXC6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
COPS9Q8WXC6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS9Q8WXC6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS9Q8WXC6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS9Q8WXC6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS9Q8WXC6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS9Q8WXC6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS9Q8WXC6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS9Q8WXC6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS9Q8WXC6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS9Q8WXC6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS9Q8WXC6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS9Q8WXC6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS9Q8WXC6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS9Q8WXC6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS9Q8WXC6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS9Q8WXC6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS9Q8WXC6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS9Q8WXC6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS9Q8WXC6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS9Q8WXC6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS9Q8WXC6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms