Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX33Q8WV41 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX33Q8WV41 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX33Q8WV41 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX33Q8WV41 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX33Q8WV41 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX33Q8WV41 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX33Q8WV41 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX33Q8WV41 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX33Q8WV41 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX33Q8WV41 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX33Q8WV41 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX33Q8WV41 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX33Q8WV41 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX33Q8WV41 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX33Q8WV41 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX33Q8WV41 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX33Q8WV41 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX33Q8WV41 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX33Q8WV41 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX33Q8WV41 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX33Q8WV41 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX33Q8WV41 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX33Q8WV41 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX33Q8WV41 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX33Q8WV41 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX33Q8WV41 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX33Q8WV41 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX33Q8WV41 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX33Q8WV41 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX33Q8WV41 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX33Q8WV41 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX33Q8WV41 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX33Q8WV41 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX33Q8WV41 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX33Q8WV41 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX33Q8WV41 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX33Q8WV41 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX33Q8WV41 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX33Q8WV41 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX33Q8WV41 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX33Q8WV41 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX33Q8WV41 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX33Q8WV41 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX33Q8WV41 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX33Q8WV41 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX33Q8WV41 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX33Q8WV41 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX33Q8WV41 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX33Q8WV41 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX33Q8WV41 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX33Q8WV41 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX33Q8WV41 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX33Q8WV41 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX33Q8WV41 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX33Q8WV41 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX33Q8WV41 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX33Q8WV41 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX33Q8WV41 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX33Q8WV41 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX33Q8WV41 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX33Q8WV41 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX33Q8WV41 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX33Q8WV41 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX33Q8WV41 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX33Q8WV41 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX33Q8WV41 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX33Q8WV41 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX33Q8WV41 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX33Q8WV41 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX33Q8WV41 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX33Q8WV41 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX33Q8WV41 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX33Q8WV41 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX33Q8WV41 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX33Q8WV41 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms