Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSC4DQ8WTU2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSC4DQ8WTU2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSC4DQ8WTU2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSC4DQ8WTU2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSC4DQ8WTU2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSC4DQ8WTU2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSC4DQ8WTU2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSC4DQ8WTU2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSC4DQ8WTU2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSC4DQ8WTU2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSC4DQ8WTU2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSC4DQ8WTU2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSC4DQ8WTU2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSC4DQ8WTU2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSC4DQ8WTU2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SSC4DQ8WTU2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SSC4DQ8WTU2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSC4DQ8WTU2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SSC4DQ8WTU2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSC4DQ8WTU2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSC4DQ8WTU2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSC4DQ8WTU2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSC4DQ8WTU2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSC4DQ8WTU2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSC4DQ8WTU2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSC4DQ8WTU2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SSC4DQ8WTU2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC4DQ8WTU2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC4DQ8WTU2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSC4DQ8WTU2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSC4DQ8WTU2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSC4DQ8WTU2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSC4DQ8WTU2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSC4DQ8WTU2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSC4DQ8WTU2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSC4DQ8WTU2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSC4DQ8WTU2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSC4DQ8WTU2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSC4DQ8WTU2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSC4DQ8WTU2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSC4DQ8WTU2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSC4DQ8WTU2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SSC4DQ8WTU2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSC4DQ8WTU2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSC4DQ8WTU2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSC4DQ8WTU2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSC4DQ8WTU2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSC4DQ8WTU2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSC4DQ8WTU2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSC4DQ8WTU2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SSC4DQ8WTU2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSC4DQ8WTU2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSC4DQ8WTU2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSC4DQ8WTU2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSC4DQ8WTU2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSC4DQ8WTU2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSC4DQ8WTU2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSC4DQ8WTU2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSC4DQ8WTU2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSC4DQ8WTU2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SSC4DQ8WTU2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSC4DQ8WTU2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSC4DQ8WTU2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSC4DQ8WTU2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SSC4DQ8WTU2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSC4DQ8WTU2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSC4DQ8WTU2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSC4DQ8WTU2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSC4DQ8WTU2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSC4DQ8WTU2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SSC4DQ8WTU2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSC4DQ8WTU2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSC4DQ8WTU2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSC4DQ8WTU2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSC4DQ8WTU2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSC4DQ8WTU2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC4DQ8WTU2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC4DQ8WTU2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC4DQ8WTU2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC4DQ8WTU2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC4DQ8WTU2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSC4DQ8WTU2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC4DQ8WTU2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC4DQ8WTU2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSC4DQ8WTU2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSC4DQ8WTU2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSC4DQ8WTU2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SSC4DQ8WTU2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSC4DQ8WTU2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSC4DQ8WTU2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSC4DQ8WTU2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSC4DQ8WTU2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSC4DQ8WTU2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSC4DQ8WTU2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSC4DQ8WTU2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSC4DQ8WTU2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSC4DQ8WTU2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSC4DQ8WTU2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSC4DQ8WTU2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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