Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MINDY1Q8N5J2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MINDY1Q8N5J2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MINDY1Q8N5J2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MINDY1Q8N5J2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY1Q8N5J2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY1Q8N5J2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MINDY1Q8N5J2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MINDY1Q8N5J2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MINDY1Q8N5J2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MINDY1Q8N5J2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MINDY1Q8N5J2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MINDY1Q8N5J2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MINDY1Q8N5J2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MINDY1Q8N5J2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MINDY1Q8N5J2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MINDY1Q8N5J2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MINDY1Q8N5J2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MINDY1Q8N5J2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MINDY1Q8N5J2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MINDY1Q8N5J2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MINDY1Q8N5J2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MINDY1Q8N5J2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MINDY1Q8N5J2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MINDY1Q8N5J2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MINDY1Q8N5J2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MINDY1Q8N5J2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MINDY1Q8N5J2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MINDY1Q8N5J2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MINDY1Q8N5J2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MINDY1Q8N5J2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MINDY1Q8N5J2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MINDY1Q8N5J2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MINDY1Q8N5J2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MINDY1Q8N5J2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MINDY1Q8N5J2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MINDY1Q8N5J2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MINDY1Q8N5J2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MINDY1Q8N5J2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MINDY1Q8N5J2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MINDY1Q8N5J2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MINDY1Q8N5J2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MINDY1Q8N5J2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MINDY1Q8N5J2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MINDY1Q8N5J2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MINDY1Q8N5J2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MINDY1Q8N5J2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MINDY1Q8N5J2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MINDY1Q8N5J2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MINDY1Q8N5J2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MINDY1Q8N5J2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MINDY1Q8N5J2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MINDY1Q8N5J2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MINDY1Q8N5J2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MINDY1Q8N5J2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MINDY1Q8N5J2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MINDY1Q8N5J2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MINDY1Q8N5J2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MINDY1Q8N5J2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MINDY1Q8N5J2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MINDY1Q8N5J2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MINDY1Q8N5J2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MINDY1Q8N5J2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MINDY1Q8N5J2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MINDY1Q8N5J2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MINDY1Q8N5J2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MINDY1Q8N5J2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms