Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GPC2Q8N158 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
GPC2Q8N158 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
GPC2Q8N158 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
GPC2Q8N158 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GPC2Q8N158 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
GPC2Q8N158 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GPC2Q8N158 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GPC2Q8N158 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GPC2Q8N158 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GPC2Q8N158 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GPC2Q8N158 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
GPC2Q8N158 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GPC2Q8N158 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GPC2Q8N158 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GPC2Q8N158 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GPC2Q8N158 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GPC2Q8N158 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GPC2Q8N158 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GPC2Q8N158 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GPC2Q8N158 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GPC2Q8N158 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GPC2Q8N158 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GPC2Q8N158 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GPC2Q8N158 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
GPC2Q8N158 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GPC2Q8N158 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GPC2Q8N158 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GPC2Q8N158 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GPC2Q8N158 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GPC2Q8N158 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
GPC2Q8N158 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GPC2Q8N158 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GPC2Q8N158 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GPC2Q8N158 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GPC2Q8N158 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GPC2Q8N158 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
GPC2Q8N158 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GPC2Q8N158 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
GPC2Q8N158 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GPC2Q8N158 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GPC2Q8N158 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GPC2Q8N158 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GPC2Q8N158 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GPC2Q8N158 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GPC2Q8N158 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
GPC2Q8N158 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GPC2Q8N158 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GPC2Q8N158 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GPC2Q8N158 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GPC2Q8N158 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GPC2Q8N158 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GPC2Q8N158 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
GPC2Q8N158 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GPC2Q8N158 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GPC2Q8N158 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GPC2Q8N158 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GPC2Q8N158 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GPC2Q8N158 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GPC2Q8N158 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GPC2Q8N158 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GPC2Q8N158 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GPC2Q8N158 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPC2Q8N158 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPC2Q8N158 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GPC2Q8N158 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GPC2Q8N158 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
GPC2Q8N158 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GPC2Q8N158 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GPC2Q8N158 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GPC2Q8N158 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GPC2Q8N158 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GPC2Q8N158 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GPC2Q8N158 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GPC2Q8N158 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
GPC2Q8N158 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GPC2Q8N158 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GPC2Q8N158 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
GPC2Q8N158 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GPC2Q8N158 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GPC2Q8N158 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GPC2Q8N158 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GPC2Q8N158 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GPC2Q8N158 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GPC2Q8N158 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GPC2Q8N158 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GPC2Q8N158 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GPC2Q8N158 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GPC2Q8N158 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GPC2Q8N158 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GPC2Q8N158 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GPC2Q8N158 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GPC2Q8N158 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GPC2Q8N158 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GPC2Q8N158 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GPC2Q8N158 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GPC2Q8N158 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GPC2Q8N158 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GPC2Q8N158 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GPC2Q8N158 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms