Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
P3H3Q8IVL6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
P3H3Q8IVL6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
P3H3Q8IVL6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
P3H3Q8IVL6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
P3H3Q8IVL6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
P3H3Q8IVL6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
P3H3Q8IVL6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
P3H3Q8IVL6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
P3H3Q8IVL6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
P3H3Q8IVL6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
P3H3Q8IVL6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
P3H3Q8IVL6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.96■■■■■ 4.79
P3H3Q8IVL6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
P3H3Q8IVL6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
P3H3Q8IVL6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
P3H3Q8IVL6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
P3H3Q8IVL6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
P3H3Q8IVL6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
P3H3Q8IVL6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
P3H3Q8IVL6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
P3H3Q8IVL6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
P3H3Q8IVL6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
P3H3Q8IVL6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
P3H3Q8IVL6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
P3H3Q8IVL6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC44.83■■■■■ 4.77
P3H3Q8IVL6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
P3H3Q8IVL6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.81■■■■■ 4.76
P3H3Q8IVL6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.81■■■■■ 4.76
P3H3Q8IVL6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
P3H3Q8IVL6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
P3H3Q8IVL6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
P3H3Q8IVL6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
P3H3Q8IVL6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
P3H3Q8IVL6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
P3H3Q8IVL6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.75
P3H3Q8IVL6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.75
P3H3Q8IVL6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
P3H3Q8IVL6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
P3H3Q8IVL6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
P3H3Q8IVL6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
P3H3Q8IVL6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
P3H3Q8IVL6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
P3H3Q8IVL6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
P3H3Q8IVL6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
P3H3Q8IVL6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
P3H3Q8IVL6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
P3H3Q8IVL6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
P3H3Q8IVL6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
P3H3Q8IVL6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
P3H3Q8IVL6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
P3H3Q8IVL6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
P3H3Q8IVL6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
P3H3Q8IVL6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
P3H3Q8IVL6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
P3H3Q8IVL6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
P3H3Q8IVL6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
P3H3Q8IVL6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC44.49■■■■■ 4.71
P3H3Q8IVL6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
P3H3Q8IVL6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
P3H3Q8IVL6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
P3H3Q8IVL6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
P3H3Q8IVL6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
P3H3Q8IVL6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
P3H3Q8IVL6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
P3H3Q8IVL6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
P3H3Q8IVL6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
P3H3Q8IVL6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.7
P3H3Q8IVL6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
P3H3Q8IVL6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
P3H3Q8IVL6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
P3H3Q8IVL6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
P3H3Q8IVL6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
P3H3Q8IVL6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
P3H3Q8IVL6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
P3H3Q8IVL6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
P3H3Q8IVL6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
P3H3Q8IVL6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
P3H3Q8IVL6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
P3H3Q8IVL6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
P3H3Q8IVL6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
P3H3Q8IVL6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
P3H3Q8IVL6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
P3H3Q8IVL6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
P3H3Q8IVL6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
P3H3Q8IVL6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC44.2■■■■■ 4.67
P3H3Q8IVL6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
P3H3Q8IVL6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
P3H3Q8IVL6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
P3H3Q8IVL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.13■■■■■ 4.66
P3H3Q8IVL6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
P3H3Q8IVL6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
P3H3Q8IVL6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
P3H3Q8IVL6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
P3H3Q8IVL6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
P3H3Q8IVL6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
P3H3Q8IVL6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
P3H3Q8IVL6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
P3H3Q8IVL6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
P3H3Q8IVL6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms