Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVG5

SAMD9L, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9LQ8IVG5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
SAMD9LQ8IVG5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SAMD9LQ8IVG5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
SAMD9LQ8IVG5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SAMD9LQ8IVG5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
SAMD9LQ8IVG5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
SAMD9LQ8IVG5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
SAMD9LQ8IVG5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
SAMD9LQ8IVG5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
SAMD9LQ8IVG5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
SAMD9LQ8IVG5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.95■■■■■ 4.47
SAMD9LQ8IVG5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.95■■■■■ 4.47
SAMD9LQ8IVG5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.47
SAMD9LQ8IVG5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SAMD9LQ8IVG5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
SAMD9LQ8IVG5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
SAMD9LQ8IVG5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.45
SAMD9LQ8IVG5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.88■■■■■ 4.45
SAMD9LQ8IVG5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
SAMD9LQ8IVG5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
SAMD9LQ8IVG5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
SAMD9LQ8IVG5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
SAMD9LQ8IVG5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
SAMD9LQ8IVG5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
SAMD9LQ8IVG5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
SAMD9LQ8IVG5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SAMD9LQ8IVG5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SAMD9LQ8IVG5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SAMD9LQ8IVG5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SAMD9LQ8IVG5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SAMD9LQ8IVG5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SAMD9LQ8IVG5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
SAMD9LQ8IVG5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
SAMD9LQ8IVG5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
SAMD9LQ8IVG5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
SAMD9LQ8IVG5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
SAMD9LQ8IVG5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
SAMD9LQ8IVG5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
SAMD9LQ8IVG5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
SAMD9LQ8IVG5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
SAMD9LQ8IVG5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
SAMD9LQ8IVG5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
SAMD9LQ8IVG5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
SAMD9LQ8IVG5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SAMD9LQ8IVG5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SAMD9LQ8IVG5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
SAMD9LQ8IVG5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
SAMD9LQ8IVG5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.44■■■■■ 4.39
SAMD9LQ8IVG5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
SAMD9LQ8IVG5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SAMD9LQ8IVG5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SAMD9LQ8IVG5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SAMD9LQ8IVG5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
SAMD9LQ8IVG5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SAMD9LQ8IVG5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
SAMD9LQ8IVG5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SAMD9LQ8IVG5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SAMD9LQ8IVG5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SAMD9LQ8IVG5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
SAMD9LQ8IVG5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SAMD9LQ8IVG5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
SAMD9LQ8IVG5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SAMD9LQ8IVG5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SAMD9LQ8IVG5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SAMD9LQ8IVG5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
SAMD9LQ8IVG5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
SAMD9LQ8IVG5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SAMD9LQ8IVG5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
SAMD9LQ8IVG5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
SAMD9LQ8IVG5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SAMD9LQ8IVG5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
SAMD9LQ8IVG5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
SAMD9LQ8IVG5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
SAMD9LQ8IVG5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
SAMD9LQ8IVG5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
SAMD9LQ8IVG5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SAMD9LQ8IVG5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SAMD9LQ8IVG5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SAMD9LQ8IVG5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SAMD9LQ8IVG5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
SAMD9LQ8IVG5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
SAMD9LQ8IVG5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
SAMD9LQ8IVG5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
SAMD9LQ8IVG5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
SAMD9LQ8IVG5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
SAMD9LQ8IVG5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
SAMD9LQ8IVG5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms