Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ZFYVE16Q7Z3T8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ZFYVE16Q7Z3T8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ZFYVE16Q7Z3T8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
ZFYVE16Q7Z3T8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
ZFYVE16Q7Z3T8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ZFYVE16Q7Z3T8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ZFYVE16Q7Z3T8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ZFYVE16Q7Z3T8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
ZFYVE16Q7Z3T8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
ZFYVE16Q7Z3T8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
ZFYVE16Q7Z3T8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ZFYVE16Q7Z3T8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
ZFYVE16Q7Z3T8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
ZFYVE16Q7Z3T8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
ZFYVE16Q7Z3T8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
ZFYVE16Q7Z3T8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
ZFYVE16Q7Z3T8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
ZFYVE16Q7Z3T8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
ZFYVE16Q7Z3T8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
ZFYVE16Q7Z3T8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ZFYVE16Q7Z3T8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ZFYVE16Q7Z3T8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
ZFYVE16Q7Z3T8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
ZFYVE16Q7Z3T8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
ZFYVE16Q7Z3T8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ZFYVE16Q7Z3T8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ZFYVE16Q7Z3T8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ZFYVE16Q7Z3T8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
ZFYVE16Q7Z3T8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
ZFYVE16Q7Z3T8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
ZFYVE16Q7Z3T8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ZFYVE16Q7Z3T8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
ZFYVE16Q7Z3T8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
ZFYVE16Q7Z3T8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
ZFYVE16Q7Z3T8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
ZFYVE16Q7Z3T8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
ZFYVE16Q7Z3T8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
ZFYVE16Q7Z3T8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
ZFYVE16Q7Z3T8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
ZFYVE16Q7Z3T8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
ZFYVE16Q7Z3T8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ZFYVE16Q7Z3T8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
ZFYVE16Q7Z3T8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
ZFYVE16Q7Z3T8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
ZFYVE16Q7Z3T8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
ZFYVE16Q7Z3T8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
ZFYVE16Q7Z3T8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
ZFYVE16Q7Z3T8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
ZFYVE16Q7Z3T8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
ZFYVE16Q7Z3T8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ZFYVE16Q7Z3T8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ZFYVE16Q7Z3T8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
ZFYVE16Q7Z3T8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
ZFYVE16Q7Z3T8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ZFYVE16Q7Z3T8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ZFYVE16Q7Z3T8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ZFYVE16Q7Z3T8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ZFYVE16Q7Z3T8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ZFYVE16Q7Z3T8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ZFYVE16Q7Z3T8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
ZFYVE16Q7Z3T8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
ZFYVE16Q7Z3T8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
ZFYVE16Q7Z3T8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
ZFYVE16Q7Z3T8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
ZFYVE16Q7Z3T8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
ZFYVE16Q7Z3T8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
ZFYVE16Q7Z3T8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ZFYVE16Q7Z3T8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ZFYVE16Q7Z3T8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
ZFYVE16Q7Z3T8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ZFYVE16Q7Z3T8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ZFYVE16Q7Z3T8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ZFYVE16Q7Z3T8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
ZFYVE16Q7Z3T8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ZFYVE16Q7Z3T8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ZFYVE16Q7Z3T8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ZFYVE16Q7Z3T8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ZFYVE16Q7Z3T8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ZFYVE16Q7Z3T8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
ZFYVE16Q7Z3T8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ZFYVE16Q7Z3T8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
ZFYVE16Q7Z3T8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
ZFYVE16Q7Z3T8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ZFYVE16Q7Z3T8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
ZFYVE16Q7Z3T8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ZFYVE16Q7Z3T8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
ZFYVE16Q7Z3T8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
ZFYVE16Q7Z3T8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
ZFYVE16Q7Z3T8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
ZFYVE16Q7Z3T8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
ZFYVE16Q7Z3T8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
ZFYVE16Q7Z3T8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms