Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX9Q7RTT3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSX9Q7RTT3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX9Q7RTT3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX9Q7RTT3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX9Q7RTT3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX9Q7RTT3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX9Q7RTT3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX9Q7RTT3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX9Q7RTT3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX9Q7RTT3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX9Q7RTT3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX9Q7RTT3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX9Q7RTT3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX9Q7RTT3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX9Q7RTT3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX9Q7RTT3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX9Q7RTT3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX9Q7RTT3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX9Q7RTT3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX9Q7RTT3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX9Q7RTT3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX9Q7RTT3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSX9Q7RTT3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX9Q7RTT3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX9Q7RTT3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX9Q7RTT3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX9Q7RTT3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX9Q7RTT3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX9Q7RTT3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX9Q7RTT3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX9Q7RTT3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX9Q7RTT3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX9Q7RTT3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX9Q7RTT3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX9Q7RTT3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX9Q7RTT3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX9Q7RTT3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX9Q7RTT3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX9Q7RTT3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX9Q7RTT3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX9Q7RTT3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX9Q7RTT3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX9Q7RTT3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX9Q7RTT3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX9Q7RTT3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX9Q7RTT3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX9Q7RTT3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX9Q7RTT3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX9Q7RTT3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX9Q7RTT3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX9Q7RTT3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX9Q7RTT3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX9Q7RTT3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX9Q7RTT3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms