Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMIM5Q71RC9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMIM5Q71RC9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
SMIM5Q71RC9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMIM5Q71RC9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMIM5Q71RC9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
SMIM5Q71RC9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMIM5Q71RC9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMIM5Q71RC9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMIM5Q71RC9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMIM5Q71RC9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMIM5Q71RC9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMIM5Q71RC9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMIM5Q71RC9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMIM5Q71RC9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
SMIM5Q71RC9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
SMIM5Q71RC9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
SMIM5Q71RC9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMIM5Q71RC9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMIM5Q71RC9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMIM5Q71RC9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMIM5Q71RC9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMIM5Q71RC9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMIM5Q71RC9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMIM5Q71RC9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMIM5Q71RC9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SMIM5Q71RC9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SMIM5Q71RC9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMIM5Q71RC9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMIM5Q71RC9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMIM5Q71RC9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
SMIM5Q71RC9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMIM5Q71RC9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMIM5Q71RC9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMIM5Q71RC9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMIM5Q71RC9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMIM5Q71RC9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMIM5Q71RC9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMIM5Q71RC9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMIM5Q71RC9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMIM5Q71RC9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMIM5Q71RC9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMIM5Q71RC9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMIM5Q71RC9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMIM5Q71RC9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SMIM5Q71RC9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMIM5Q71RC9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMIM5Q71RC9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMIM5Q71RC9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMIM5Q71RC9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
SMIM5Q71RC9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMIM5Q71RC9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMIM5Q71RC9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMIM5Q71RC9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMIM5Q71RC9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMIM5Q71RC9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMIM5Q71RC9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMIM5Q71RC9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMIM5Q71RC9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMIM5Q71RC9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMIM5Q71RC9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMIM5Q71RC9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMIM5Q71RC9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SMIM5Q71RC9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
SMIM5Q71RC9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMIM5Q71RC9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMIM5Q71RC9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMIM5Q71RC9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMIM5Q71RC9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMIM5Q71RC9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMIM5Q71RC9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMIM5Q71RC9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMIM5Q71RC9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMIM5Q71RC9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMIM5Q71RC9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
SMIM5Q71RC9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMIM5Q71RC9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMIM5Q71RC9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMIM5Q71RC9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMIM5Q71RC9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMIM5Q71RC9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMIM5Q71RC9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMIM5Q71RC9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMIM5Q71RC9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMIM5Q71RC9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMIM5Q71RC9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMIM5Q71RC9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMIM5Q71RC9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms