Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU64

CFAP65, Cilia- and flagella-associated protein 65, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP65Q6ZU64 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CFAP65Q6ZU64 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CFAP65Q6ZU64 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CFAP65Q6ZU64 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CFAP65Q6ZU64 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CFAP65Q6ZU64 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CFAP65Q6ZU64 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CFAP65Q6ZU64 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
CFAP65Q6ZU64 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
CFAP65Q6ZU64 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
CFAP65Q6ZU64 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CFAP65Q6ZU64 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CFAP65Q6ZU64 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CFAP65Q6ZU64 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CFAP65Q6ZU64 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CFAP65Q6ZU64 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CFAP65Q6ZU64 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CFAP65Q6ZU64 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CFAP65Q6ZU64 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CFAP65Q6ZU64 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CFAP65Q6ZU64 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
CFAP65Q6ZU64 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CFAP65Q6ZU64 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CFAP65Q6ZU64 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CFAP65Q6ZU64 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CFAP65Q6ZU64 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CFAP65Q6ZU64 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CFAP65Q6ZU64 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CFAP65Q6ZU64 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CFAP65Q6ZU64 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CFAP65Q6ZU64 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CFAP65Q6ZU64 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
CFAP65Q6ZU64 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CFAP65Q6ZU64 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
CFAP65Q6ZU64 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CFAP65Q6ZU64 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CFAP65Q6ZU64 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CFAP65Q6ZU64 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CFAP65Q6ZU64 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CFAP65Q6ZU64 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CFAP65Q6ZU64 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CFAP65Q6ZU64 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
CFAP65Q6ZU64 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CFAP65Q6ZU64 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
CFAP65Q6ZU64 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
CFAP65Q6ZU64 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.15
CFAP65Q6ZU64 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CFAP65Q6ZU64 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CFAP65Q6ZU64 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
CFAP65Q6ZU64 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
CFAP65Q6ZU64 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CFAP65Q6ZU64 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CFAP65Q6ZU64 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CFAP65Q6ZU64 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CFAP65Q6ZU64 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CFAP65Q6ZU64 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CFAP65Q6ZU64 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CFAP65Q6ZU64 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
CFAP65Q6ZU64 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CFAP65Q6ZU64 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CFAP65Q6ZU64 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CFAP65Q6ZU64 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CFAP65Q6ZU64 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CFAP65Q6ZU64 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CFAP65Q6ZU64 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CFAP65Q6ZU64 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CFAP65Q6ZU64 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CFAP65Q6ZU64 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CFAP65Q6ZU64 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CFAP65Q6ZU64 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CFAP65Q6ZU64 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CFAP65Q6ZU64 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CFAP65Q6ZU64 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CFAP65Q6ZU64 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CFAP65Q6ZU64 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CFAP65Q6ZU64 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CFAP65Q6ZU64 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CFAP65Q6ZU64 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CFAP65Q6ZU64 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CFAP65Q6ZU64 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CFAP65Q6ZU64 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CFAP65Q6ZU64 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CFAP65Q6ZU64 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CFAP65Q6ZU64 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CFAP65Q6ZU64 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CFAP65Q6ZU64 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CFAP65Q6ZU64 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CFAP65Q6ZU64 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CFAP65Q6ZU64 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CFAP65Q6ZU64 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CFAP65Q6ZU64 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CFAP65Q6ZU64 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CFAP65Q6ZU64 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CFAP65Q6ZU64 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CFAP65Q6ZU64 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CFAP65Q6ZU64 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CFAP65Q6ZU64 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CFAP65Q6ZU64 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CFAP65Q6ZU64 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CFAP65Q6ZU64 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 826.5 ms