Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIAT1Q6ZQX7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIAT1Q6ZQX7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIAT1Q6ZQX7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIAT1Q6ZQX7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIAT1Q6ZQX7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIAT1Q6ZQX7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIAT1Q6ZQX7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIAT1Q6ZQX7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIAT1Q6ZQX7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIAT1Q6ZQX7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIAT1Q6ZQX7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIAT1Q6ZQX7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIAT1Q6ZQX7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIAT1Q6ZQX7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIAT1Q6ZQX7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIAT1Q6ZQX7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIAT1Q6ZQX7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIAT1Q6ZQX7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIAT1Q6ZQX7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIAT1Q6ZQX7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIAT1Q6ZQX7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIAT1Q6ZQX7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LIAT1Q6ZQX7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIAT1Q6ZQX7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIAT1Q6ZQX7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIAT1Q6ZQX7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIAT1Q6ZQX7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIAT1Q6ZQX7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIAT1Q6ZQX7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIAT1Q6ZQX7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIAT1Q6ZQX7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIAT1Q6ZQX7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIAT1Q6ZQX7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIAT1Q6ZQX7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIAT1Q6ZQX7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIAT1Q6ZQX7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIAT1Q6ZQX7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIAT1Q6ZQX7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIAT1Q6ZQX7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIAT1Q6ZQX7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIAT1Q6ZQX7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIAT1Q6ZQX7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIAT1Q6ZQX7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LIAT1Q6ZQX7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIAT1Q6ZQX7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIAT1Q6ZQX7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIAT1Q6ZQX7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIAT1Q6ZQX7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIAT1Q6ZQX7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIAT1Q6ZQX7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIAT1Q6ZQX7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIAT1Q6ZQX7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIAT1Q6ZQX7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIAT1Q6ZQX7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIAT1Q6ZQX7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIAT1Q6ZQX7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIAT1Q6ZQX7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIAT1Q6ZQX7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIAT1Q6ZQX7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIAT1Q6ZQX7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIAT1Q6ZQX7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIAT1Q6ZQX7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIAT1Q6ZQX7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIAT1Q6ZQX7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIAT1Q6ZQX7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIAT1Q6ZQX7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIAT1Q6ZQX7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIAT1Q6ZQX7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIAT1Q6ZQX7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIAT1Q6ZQX7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIAT1Q6ZQX7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIAT1Q6ZQX7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIAT1Q6ZQX7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIAT1Q6ZQX7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIAT1Q6ZQX7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIAT1Q6ZQX7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIAT1Q6ZQX7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIAT1Q6ZQX7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIAT1Q6ZQX7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIAT1Q6ZQX7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIAT1Q6ZQX7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIAT1Q6ZQX7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIAT1Q6ZQX7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIAT1Q6ZQX7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms