Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SPNS3Q6ZMD2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPNS3Q6ZMD2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPNS3Q6ZMD2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS3Q6ZMD2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS3Q6ZMD2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS3Q6ZMD2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPNS3Q6ZMD2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPNS3Q6ZMD2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPNS3Q6ZMD2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPNS3Q6ZMD2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPNS3Q6ZMD2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPNS3Q6ZMD2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPNS3Q6ZMD2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS3Q6ZMD2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS3Q6ZMD2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS3Q6ZMD2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS3Q6ZMD2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS3Q6ZMD2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS3Q6ZMD2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS3Q6ZMD2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS3Q6ZMD2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPNS3Q6ZMD2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPNS3Q6ZMD2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPNS3Q6ZMD2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPNS3Q6ZMD2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPNS3Q6ZMD2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPNS3Q6ZMD2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPNS3Q6ZMD2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPNS3Q6ZMD2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPNS3Q6ZMD2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPNS3Q6ZMD2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPNS3Q6ZMD2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPNS3Q6ZMD2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPNS3Q6ZMD2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPNS3Q6ZMD2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPNS3Q6ZMD2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPNS3Q6ZMD2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPNS3Q6ZMD2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPNS3Q6ZMD2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPNS3Q6ZMD2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPNS3Q6ZMD2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPNS3Q6ZMD2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPNS3Q6ZMD2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPNS3Q6ZMD2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPNS3Q6ZMD2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPNS3Q6ZMD2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPNS3Q6ZMD2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPNS3Q6ZMD2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPNS3Q6ZMD2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPNS3Q6ZMD2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPNS3Q6ZMD2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPNS3Q6ZMD2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPNS3Q6ZMD2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPNS3Q6ZMD2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPNS3Q6ZMD2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPNS3Q6ZMD2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPNS3Q6ZMD2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPNS3Q6ZMD2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPNS3Q6ZMD2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPNS3Q6ZMD2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPNS3Q6ZMD2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPNS3Q6ZMD2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPNS3Q6ZMD2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPNS3Q6ZMD2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPNS3Q6ZMD2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPNS3Q6ZMD2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPNS3Q6ZMD2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPNS3Q6ZMD2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPNS3Q6ZMD2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPNS3Q6ZMD2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPNS3Q6ZMD2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPNS3Q6ZMD2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPNS3Q6ZMD2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPNS3Q6ZMD2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPNS3Q6ZMD2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPNS3Q6ZMD2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPNS3Q6ZMD2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPNS3Q6ZMD2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPNS3Q6ZMD2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPNS3Q6ZMD2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPNS3Q6ZMD2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms