Protein–RNA interactions for Protein: Q6UDR6

SPINT4, Kunitz-type protease inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT4Q6UDR6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SPINT4Q6UDR6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPINT4Q6UDR6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPINT4Q6UDR6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPINT4Q6UDR6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPINT4Q6UDR6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPINT4Q6UDR6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPINT4Q6UDR6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPINT4Q6UDR6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPINT4Q6UDR6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPINT4Q6UDR6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPINT4Q6UDR6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPINT4Q6UDR6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPINT4Q6UDR6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPINT4Q6UDR6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPINT4Q6UDR6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPINT4Q6UDR6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINT4Q6UDR6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPINT4Q6UDR6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPINT4Q6UDR6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPINT4Q6UDR6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPINT4Q6UDR6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPINT4Q6UDR6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPINT4Q6UDR6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPINT4Q6UDR6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPINT4Q6UDR6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPINT4Q6UDR6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPINT4Q6UDR6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPINT4Q6UDR6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPINT4Q6UDR6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms