Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL17Q6TDP4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL17Q6TDP4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL17Q6TDP4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL17Q6TDP4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL17Q6TDP4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL17Q6TDP4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL17Q6TDP4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL17Q6TDP4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL17Q6TDP4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL17Q6TDP4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL17Q6TDP4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL17Q6TDP4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL17Q6TDP4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL17Q6TDP4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL17Q6TDP4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL17Q6TDP4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL17Q6TDP4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL17Q6TDP4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL17Q6TDP4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL17Q6TDP4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL17Q6TDP4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL17Q6TDP4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL17Q6TDP4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL17Q6TDP4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL17Q6TDP4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL17Q6TDP4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL17Q6TDP4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL17Q6TDP4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL17Q6TDP4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL17Q6TDP4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL17Q6TDP4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL17Q6TDP4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL17Q6TDP4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL17Q6TDP4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL17Q6TDP4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL17Q6TDP4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL17Q6TDP4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL17Q6TDP4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL17Q6TDP4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL17Q6TDP4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL17Q6TDP4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL17Q6TDP4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL17Q6TDP4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL17Q6TDP4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL17Q6TDP4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL17Q6TDP4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL17Q6TDP4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL17Q6TDP4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL17Q6TDP4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL17Q6TDP4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL17Q6TDP4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL17Q6TDP4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL17Q6TDP4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL17Q6TDP4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL17Q6TDP4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL17Q6TDP4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL17Q6TDP4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL17Q6TDP4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL17Q6TDP4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL17Q6TDP4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL17Q6TDP4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL17Q6TDP4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms