Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDE2Q6IQ49 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDE2Q6IQ49 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SDE2Q6IQ49 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SDE2Q6IQ49 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SDE2Q6IQ49 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SDE2Q6IQ49 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SDE2Q6IQ49 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SDE2Q6IQ49 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SDE2Q6IQ49 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SDE2Q6IQ49 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SDE2Q6IQ49 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDE2Q6IQ49 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDE2Q6IQ49 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDE2Q6IQ49 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SDE2Q6IQ49 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SDE2Q6IQ49 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDE2Q6IQ49 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDE2Q6IQ49 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDE2Q6IQ49 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDE2Q6IQ49 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SDE2Q6IQ49 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SDE2Q6IQ49 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDE2Q6IQ49 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SDE2Q6IQ49 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SDE2Q6IQ49 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDE2Q6IQ49 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDE2Q6IQ49 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SDE2Q6IQ49 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SDE2Q6IQ49 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SDE2Q6IQ49 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDE2Q6IQ49 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SDE2Q6IQ49 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDE2Q6IQ49 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDE2Q6IQ49 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDE2Q6IQ49 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDE2Q6IQ49 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDE2Q6IQ49 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SDE2Q6IQ49 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SDE2Q6IQ49 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SDE2Q6IQ49 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SDE2Q6IQ49 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDE2Q6IQ49 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDE2Q6IQ49 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDE2Q6IQ49 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDE2Q6IQ49 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDE2Q6IQ49 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDE2Q6IQ49 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDE2Q6IQ49 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDE2Q6IQ49 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDE2Q6IQ49 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDE2Q6IQ49 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDE2Q6IQ49 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDE2Q6IQ49 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SDE2Q6IQ49 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDE2Q6IQ49 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDE2Q6IQ49 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDE2Q6IQ49 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDE2Q6IQ49 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDE2Q6IQ49 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDE2Q6IQ49 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SDE2Q6IQ49 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SDE2Q6IQ49 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SDE2Q6IQ49 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SDE2Q6IQ49 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SDE2Q6IQ49 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SDE2Q6IQ49 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SDE2Q6IQ49 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SDE2Q6IQ49 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SDE2Q6IQ49 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SDE2Q6IQ49 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SDE2Q6IQ49 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SDE2Q6IQ49 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SDE2Q6IQ49 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SDE2Q6IQ49 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SDE2Q6IQ49 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SDE2Q6IQ49 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SDE2Q6IQ49 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SDE2Q6IQ49 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SDE2Q6IQ49 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SDE2Q6IQ49 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SDE2Q6IQ49 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SDE2Q6IQ49 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SDE2Q6IQ49 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDE2Q6IQ49 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SDE2Q6IQ49 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDE2Q6IQ49 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SDE2Q6IQ49 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SDE2Q6IQ49 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDE2Q6IQ49 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDE2Q6IQ49 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SDE2Q6IQ49 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDE2Q6IQ49 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SDE2Q6IQ49 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SDE2Q6IQ49 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SDE2Q6IQ49 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDE2Q6IQ49 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDE2Q6IQ49 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms