Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB12Q6IQ22 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB12Q6IQ22 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB12Q6IQ22 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB12Q6IQ22 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB12Q6IQ22 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB12Q6IQ22 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB12Q6IQ22 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB12Q6IQ22 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB12Q6IQ22 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB12Q6IQ22 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB12Q6IQ22 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB12Q6IQ22 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB12Q6IQ22 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB12Q6IQ22 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB12Q6IQ22 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB12Q6IQ22 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB12Q6IQ22 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB12Q6IQ22 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB12Q6IQ22 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB12Q6IQ22 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB12Q6IQ22 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB12Q6IQ22 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB12Q6IQ22 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB12Q6IQ22 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB12Q6IQ22 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB12Q6IQ22 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB12Q6IQ22 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB12Q6IQ22 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB12Q6IQ22 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB12Q6IQ22 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB12Q6IQ22 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB12Q6IQ22 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB12Q6IQ22 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB12Q6IQ22 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB12Q6IQ22 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB12Q6IQ22 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB12Q6IQ22 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB12Q6IQ22 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB12Q6IQ22 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB12Q6IQ22 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB12Q6IQ22 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB12Q6IQ22 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB12Q6IQ22 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB12Q6IQ22 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB12Q6IQ22 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB12Q6IQ22 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB12Q6IQ22 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB12Q6IQ22 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB12Q6IQ22 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB12Q6IQ22 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB12Q6IQ22 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB12Q6IQ22 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB12Q6IQ22 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB12Q6IQ22 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB12Q6IQ22 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB12Q6IQ22 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB12Q6IQ22 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB12Q6IQ22 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB12Q6IQ22 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB12Q6IQ22 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB12Q6IQ22 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB12Q6IQ22 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB12Q6IQ22 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB12Q6IQ22 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms