Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RALGAPA1Q6GYQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RALGAPA1Q6GYQ0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RALGAPA1Q6GYQ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RALGAPA1Q6GYQ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RALGAPA1Q6GYQ0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RALGAPA1Q6GYQ0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RALGAPA1Q6GYQ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RALGAPA1Q6GYQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RALGAPA1Q6GYQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RALGAPA1Q6GYQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RALGAPA1Q6GYQ0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RALGAPA1Q6GYQ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RALGAPA1Q6GYQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RALGAPA1Q6GYQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RALGAPA1Q6GYQ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RALGAPA1Q6GYQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RALGAPA1Q6GYQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RALGAPA1Q6GYQ0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RALGAPA1Q6GYQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RALGAPA1Q6GYQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RALGAPA1Q6GYQ0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RALGAPA1Q6GYQ0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RALGAPA1Q6GYQ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RALGAPA1Q6GYQ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RALGAPA1Q6GYQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RALGAPA1Q6GYQ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RALGAPA1Q6GYQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RALGAPA1Q6GYQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RALGAPA1Q6GYQ0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RALGAPA1Q6GYQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RALGAPA1Q6GYQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RALGAPA1Q6GYQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RALGAPA1Q6GYQ0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALGAPA1Q6GYQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALGAPA1Q6GYQ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALGAPA1Q6GYQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALGAPA1Q6GYQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALGAPA1Q6GYQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALGAPA1Q6GYQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RALGAPA1Q6GYQ0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RALGAPA1Q6GYQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RALGAPA1Q6GYQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RALGAPA1Q6GYQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RALGAPA1Q6GYQ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RALGAPA1Q6GYQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RALGAPA1Q6GYQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RALGAPA1Q6GYQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RALGAPA1Q6GYQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RALGAPA1Q6GYQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RALGAPA1Q6GYQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RALGAPA1Q6GYQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RALGAPA1Q6GYQ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RALGAPA1Q6GYQ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RALGAPA1Q6GYQ0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RALGAPA1Q6GYQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RALGAPA1Q6GYQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RALGAPA1Q6GYQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RALGAPA1Q6GYQ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
RALGAPA1Q6GYQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RALGAPA1Q6GYQ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RALGAPA1Q6GYQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RALGAPA1Q6GYQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RALGAPA1Q6GYQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RALGAPA1Q6GYQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RALGAPA1Q6GYQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RALGAPA1Q6GYQ0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RALGAPA1Q6GYQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RALGAPA1Q6GYQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RALGAPA1Q6GYQ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RALGAPA1Q6GYQ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RALGAPA1Q6GYQ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RALGAPA1Q6GYQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RALGAPA1Q6GYQ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RALGAPA1Q6GYQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms