Protein–RNA interactions for Protein: Q6AWC8

Putative uncharacterized protein LOC100129027, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6AWC8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q6AWC8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q6AWC8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q6AWC8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q6AWC8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q6AWC8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q6AWC8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6AWC8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6AWC8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6AWC8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q6AWC8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6AWC8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6AWC8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6AWC8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6AWC8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6AWC8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6AWC8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6AWC8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6AWC8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6AWC8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6AWC8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6AWC8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6AWC8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6AWC8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q6AWC8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6AWC8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6AWC8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6AWC8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q6AWC8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q6AWC8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q6AWC8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q6AWC8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q6AWC8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q6AWC8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q6AWC8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q6AWC8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q6AWC8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q6AWC8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q6AWC8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q6AWC8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q6AWC8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q6AWC8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q6AWC8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q6AWC8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q6AWC8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q6AWC8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q6AWC8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q6AWC8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q6AWC8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q6AWC8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q6AWC8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6AWC8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6AWC8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6AWC8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q6AWC8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6AWC8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6AWC8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6AWC8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6AWC8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6AWC8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6AWC8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6AWC8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6AWC8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6AWC8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6AWC8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6AWC8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6AWC8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6AWC8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6AWC8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6AWC8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6AWC8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6AWC8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6AWC8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6AWC8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6AWC8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6AWC8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6AWC8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6AWC8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6AWC8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6AWC8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6AWC8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6AWC8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6AWC8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6AWC8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6AWC8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6AWC8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6AWC8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6AWC8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6AWC8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6AWC8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6AWC8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6AWC8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6AWC8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6AWC8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6AWC8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6AWC8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6AWC8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6AWC8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6AWC8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6AWC8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms