Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYM1

C9orf131, Uncharacterized protein C9orf131, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf131Q5VYM1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
C9orf131Q5VYM1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
C9orf131Q5VYM1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
C9orf131Q5VYM1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
C9orf131Q5VYM1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
C9orf131Q5VYM1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
C9orf131Q5VYM1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
C9orf131Q5VYM1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
C9orf131Q5VYM1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35■■■■□ 3.19
C9orf131Q5VYM1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
C9orf131Q5VYM1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
C9orf131Q5VYM1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
C9orf131Q5VYM1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
C9orf131Q5VYM1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
C9orf131Q5VYM1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
C9orf131Q5VYM1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
C9orf131Q5VYM1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
C9orf131Q5VYM1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
C9orf131Q5VYM1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
C9orf131Q5VYM1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
C9orf131Q5VYM1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
C9orf131Q5VYM1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
C9orf131Q5VYM1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
C9orf131Q5VYM1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
C9orf131Q5VYM1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
C9orf131Q5VYM1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
C9orf131Q5VYM1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
C9orf131Q5VYM1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
C9orf131Q5VYM1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
C9orf131Q5VYM1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
C9orf131Q5VYM1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
C9orf131Q5VYM1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
C9orf131Q5VYM1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
C9orf131Q5VYM1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf131Q5VYM1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
C9orf131Q5VYM1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
C9orf131Q5VYM1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
C9orf131Q5VYM1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
C9orf131Q5VYM1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
C9orf131Q5VYM1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
C9orf131Q5VYM1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
C9orf131Q5VYM1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
C9orf131Q5VYM1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
C9orf131Q5VYM1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf131Q5VYM1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf131Q5VYM1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf131Q5VYM1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf131Q5VYM1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
C9orf131Q5VYM1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
C9orf131Q5VYM1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
C9orf131Q5VYM1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
C9orf131Q5VYM1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
C9orf131Q5VYM1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
C9orf131Q5VYM1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
C9orf131Q5VYM1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
C9orf131Q5VYM1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
C9orf131Q5VYM1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
C9orf131Q5VYM1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
C9orf131Q5VYM1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
C9orf131Q5VYM1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
C9orf131Q5VYM1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
C9orf131Q5VYM1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
C9orf131Q5VYM1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
C9orf131Q5VYM1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
C9orf131Q5VYM1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
C9orf131Q5VYM1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
C9orf131Q5VYM1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
C9orf131Q5VYM1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
C9orf131Q5VYM1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
C9orf131Q5VYM1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
C9orf131Q5VYM1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
C9orf131Q5VYM1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
C9orf131Q5VYM1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
C9orf131Q5VYM1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
C9orf131Q5VYM1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
C9orf131Q5VYM1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
C9orf131Q5VYM1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
C9orf131Q5VYM1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
C9orf131Q5VYM1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
C9orf131Q5VYM1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
C9orf131Q5VYM1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
C9orf131Q5VYM1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
C9orf131Q5VYM1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
C9orf131Q5VYM1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
C9orf131Q5VYM1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
C9orf131Q5VYM1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
C9orf131Q5VYM1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
C9orf131Q5VYM1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
C9orf131Q5VYM1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
C9orf131Q5VYM1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
C9orf131Q5VYM1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
C9orf131Q5VYM1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
C9orf131Q5VYM1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
C9orf131Q5VYM1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
C9orf131Q5VYM1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
C9orf131Q5VYM1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
C9orf131Q5VYM1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
C9orf131Q5VYM1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
C9orf131Q5VYM1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
C9orf131Q5VYM1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms