Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LCN1P1Q5VSP4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCN1P1Q5VSP4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCN1P1Q5VSP4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCN1P1Q5VSP4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCN1P1Q5VSP4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCN1P1Q5VSP4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LCN1P1Q5VSP4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCN1P1Q5VSP4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LCN1P1Q5VSP4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCN1P1Q5VSP4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCN1P1Q5VSP4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCN1P1Q5VSP4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCN1P1Q5VSP4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCN1P1Q5VSP4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCN1P1Q5VSP4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCN1P1Q5VSP4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCN1P1Q5VSP4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCN1P1Q5VSP4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCN1P1Q5VSP4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCN1P1Q5VSP4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCN1P1Q5VSP4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCN1P1Q5VSP4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCN1P1Q5VSP4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCN1P1Q5VSP4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCN1P1Q5VSP4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCN1P1Q5VSP4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCN1P1Q5VSP4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCN1P1Q5VSP4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCN1P1Q5VSP4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCN1P1Q5VSP4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCN1P1Q5VSP4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCN1P1Q5VSP4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCN1P1Q5VSP4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCN1P1Q5VSP4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCN1P1Q5VSP4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCN1P1Q5VSP4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCN1P1Q5VSP4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCN1P1Q5VSP4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCN1P1Q5VSP4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCN1P1Q5VSP4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCN1P1Q5VSP4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCN1P1Q5VSP4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCN1P1Q5VSP4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCN1P1Q5VSP4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LCN1P1Q5VSP4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN1P1Q5VSP4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCN1P1Q5VSP4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCN1P1Q5VSP4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCN1P1Q5VSP4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCN1P1Q5VSP4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LCN1P1Q5VSP4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCN1P1Q5VSP4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCN1P1Q5VSP4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCN1P1Q5VSP4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCN1P1Q5VSP4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN1P1Q5VSP4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN1P1Q5VSP4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN1P1Q5VSP4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LCN1P1Q5VSP4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCN1P1Q5VSP4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN1P1Q5VSP4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCN1P1Q5VSP4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCN1P1Q5VSP4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCN1P1Q5VSP4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCN1P1Q5VSP4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCN1P1Q5VSP4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCN1P1Q5VSP4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCN1P1Q5VSP4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCN1P1Q5VSP4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCN1P1Q5VSP4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCN1P1Q5VSP4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCN1P1Q5VSP4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCN1P1Q5VSP4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCN1P1Q5VSP4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCN1P1Q5VSP4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCN1P1Q5VSP4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCN1P1Q5VSP4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCN1P1Q5VSP4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCN1P1Q5VSP4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCN1P1Q5VSP4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCN1P1Q5VSP4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCN1P1Q5VSP4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCN1P1Q5VSP4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms