Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SWT1Q5T5J6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SWT1Q5T5J6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SWT1Q5T5J6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SWT1Q5T5J6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SWT1Q5T5J6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SWT1Q5T5J6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SWT1Q5T5J6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SWT1Q5T5J6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SWT1Q5T5J6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SWT1Q5T5J6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SWT1Q5T5J6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SWT1Q5T5J6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SWT1Q5T5J6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SWT1Q5T5J6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SWT1Q5T5J6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SWT1Q5T5J6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SWT1Q5T5J6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SWT1Q5T5J6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SWT1Q5T5J6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SWT1Q5T5J6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SWT1Q5T5J6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SWT1Q5T5J6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SWT1Q5T5J6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SWT1Q5T5J6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SWT1Q5T5J6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SWT1Q5T5J6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SWT1Q5T5J6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SWT1Q5T5J6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SWT1Q5T5J6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SWT1Q5T5J6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SWT1Q5T5J6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SWT1Q5T5J6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SWT1Q5T5J6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SWT1Q5T5J6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SWT1Q5T5J6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWT1Q5T5J6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWT1Q5T5J6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWT1Q5T5J6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWT1Q5T5J6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SWT1Q5T5J6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SWT1Q5T5J6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SWT1Q5T5J6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SWT1Q5T5J6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SWT1Q5T5J6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SWT1Q5T5J6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SWT1Q5T5J6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SWT1Q5T5J6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SWT1Q5T5J6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SWT1Q5T5J6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SWT1Q5T5J6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SWT1Q5T5J6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SWT1Q5T5J6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SWT1Q5T5J6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SWT1Q5T5J6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SWT1Q5T5J6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SWT1Q5T5J6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SWT1Q5T5J6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SWT1Q5T5J6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SWT1Q5T5J6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SWT1Q5T5J6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SWT1Q5T5J6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SWT1Q5T5J6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SWT1Q5T5J6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SWT1Q5T5J6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SWT1Q5T5J6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SWT1Q5T5J6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SWT1Q5T5J6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SWT1Q5T5J6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SWT1Q5T5J6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SWT1Q5T5J6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SWT1Q5T5J6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SWT1Q5T5J6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SWT1Q5T5J6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SWT1Q5T5J6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SWT1Q5T5J6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SWT1Q5T5J6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SWT1Q5T5J6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SWT1Q5T5J6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWT1Q5T5J6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWT1Q5T5J6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SWT1Q5T5J6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWT1Q5T5J6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWT1Q5T5J6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWT1Q5T5J6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWT1Q5T5J6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWT1Q5T5J6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWT1Q5T5J6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWT1Q5T5J6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWT1Q5T5J6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SWT1Q5T5J6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWT1Q5T5J6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWT1Q5T5J6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SWT1Q5T5J6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SWT1Q5T5J6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SWT1Q5T5J6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWT1Q5T5J6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWT1Q5T5J6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWT1Q5T5J6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SWT1Q5T5J6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms