Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
SNAPC4Q5SXM2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
SNAPC4Q5SXM2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
SNAPC4Q5SXM2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
SNAPC4Q5SXM2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
SNAPC4Q5SXM2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.37■■■■■ 5.17
SNAPC4Q5SXM2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
SNAPC4Q5SXM2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC47.34■■■■■ 5.17
SNAPC4Q5SXM2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC47.33■■■■■ 5.17
SNAPC4Q5SXM2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC47.33■■■■■ 5.17
SNAPC4Q5SXM2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC47.31■■■■■ 5.16
SNAPC4Q5SXM2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC47.29■■■■■ 5.16
SNAPC4Q5SXM2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC47.27■■■■■ 5.16
SNAPC4Q5SXM2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC47.25■■■■■ 5.15
SNAPC4Q5SXM2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
SNAPC4Q5SXM2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC47.24■■■■■ 5.15
SNAPC4Q5SXM2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC47.22■■■■■ 5.15
SNAPC4Q5SXM2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC47.21■■■■■ 5.15
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC47.21■■■■■ 5.15
SNAPC4Q5SXM2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
SNAPC4Q5SXM2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC47.21■■■■■ 5.15
SNAPC4Q5SXM2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
SNAPC4Q5SXM2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
SNAPC4Q5SXM2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC47.15■■■■■ 5.14
SNAPC4Q5SXM2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
SNAPC4Q5SXM2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
SNAPC4Q5SXM2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
SNAPC4Q5SXM2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.12
SNAPC4Q5SXM2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.06■■■■■ 5.12
SNAPC4Q5SXM2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC47.06■■■■■ 5.12
SNAPC4Q5SXM2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
SNAPC4Q5SXM2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.04■■■■■ 5.12
SNAPC4Q5SXM2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
SNAPC4Q5SXM2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC46.99■■■■■ 5.11
SNAPC4Q5SXM2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC46.99■■■■■ 5.11
SNAPC4Q5SXM2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC46.98■■■■■ 5.11
SNAPC4Q5SXM2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
SNAPC4Q5SXM2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
SNAPC4Q5SXM2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.91■■■■■ 5.1
SNAPC4Q5SXM2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
SNAPC4Q5SXM2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC46.89■■■■■ 5.1
SNAPC4Q5SXM2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
SNAPC4Q5SXM2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
SNAPC4Q5SXM2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC46.86■■■■■ 5.09
SNAPC4Q5SXM2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC46.83■■■■■ 5.09
SNAPC4Q5SXM2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
SNAPC4Q5SXM2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
SNAPC4Q5SXM2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC46.78■■■■■ 5.08
SNAPC4Q5SXM2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC46.76■■■■■ 5.08
SNAPC4Q5SXM2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC46.75■■■■■ 5.07
SNAPC4Q5SXM2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
SNAPC4Q5SXM2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC46.72■■■■■ 5.07
SNAPC4Q5SXM2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
SNAPC4Q5SXM2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
SNAPC4Q5SXM2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
SNAPC4Q5SXM2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
SNAPC4Q5SXM2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
SNAPC4Q5SXM2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
SNAPC4Q5SXM2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
SNAPC4Q5SXM2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
SNAPC4Q5SXM2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
SNAPC4Q5SXM2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
SNAPC4Q5SXM2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC46.61■■■■■ 5.05
SNAPC4Q5SXM2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
SNAPC4Q5SXM2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC46.59■■■■■ 5.05
SNAPC4Q5SXM2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC46.57■■■■■ 5.05
SNAPC4Q5SXM2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
SNAPC4Q5SXM2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC46.55■■■■■ 5.04
SNAPC4Q5SXM2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
SNAPC4Q5SXM2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
SNAPC4Q5SXM2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
SNAPC4Q5SXM2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
SNAPC4Q5SXM2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.03
SNAPC4Q5SXM2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
SNAPC4Q5SXM2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC46.43■■■■■ 5.02
SNAPC4Q5SXM2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC46.42■■■■■ 5.02
SNAPC4Q5SXM2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
SNAPC4Q5SXM2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
SNAPC4Q5SXM2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
SNAPC4Q5SXM2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC46.39■■■■■ 5.02
SNAPC4Q5SXM2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.02
SNAPC4Q5SXM2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.01
SNAPC4Q5SXM2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.01
SNAPC4Q5SXM2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
SNAPC4Q5SXM2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
SNAPC4Q5SXM2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
SNAPC4Q5SXM2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
SNAPC4Q5SXM2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.33■■■■■ 5.01
SNAPC4Q5SXM2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
SNAPC4Q5SXM2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.32■■■■■ 5.01
SNAPC4Q5SXM2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
SNAPC4Q5SXM2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
SNAPC4Q5SXM2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC46.26■■■■■ 5
SNAPC4Q5SXM2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 5
SNAPC4Q5SXM2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC46.22■■■■■ 4.99
SNAPC4Q5SXM2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
SNAPC4Q5SXM2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC46.19■■■■■ 4.99
SNAPC4Q5SXM2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC46.19■■■■■ 4.98
SNAPC4Q5SXM2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
SNAPC4Q5SXM2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms