Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAPCD1Q5SSQ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAPCD1Q5SSQ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAPCD1Q5SSQ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAPCD1Q5SSQ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAPCD1Q5SSQ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAPCD1Q5SSQ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SAPCD1Q5SSQ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAPCD1Q5SSQ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAPCD1Q5SSQ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAPCD1Q5SSQ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAPCD1Q5SSQ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAPCD1Q5SSQ6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAPCD1Q5SSQ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAPCD1Q5SSQ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAPCD1Q5SSQ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAPCD1Q5SSQ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAPCD1Q5SSQ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAPCD1Q5SSQ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAPCD1Q5SSQ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAPCD1Q5SSQ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SAPCD1Q5SSQ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SAPCD1Q5SSQ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SAPCD1Q5SSQ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SAPCD1Q5SSQ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SAPCD1Q5SSQ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SAPCD1Q5SSQ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAPCD1Q5SSQ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAPCD1Q5SSQ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAPCD1Q5SSQ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAPCD1Q5SSQ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAPCD1Q5SSQ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAPCD1Q5SSQ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAPCD1Q5SSQ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAPCD1Q5SSQ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAPCD1Q5SSQ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAPCD1Q5SSQ6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAPCD1Q5SSQ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAPCD1Q5SSQ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAPCD1Q5SSQ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAPCD1Q5SSQ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAPCD1Q5SSQ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAPCD1Q5SSQ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAPCD1Q5SSQ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAPCD1Q5SSQ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAPCD1Q5SSQ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAPCD1Q5SSQ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAPCD1Q5SSQ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAPCD1Q5SSQ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAPCD1Q5SSQ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SAPCD1Q5SSQ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAPCD1Q5SSQ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAPCD1Q5SSQ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAPCD1Q5SSQ6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAPCD1Q5SSQ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAPCD1Q5SSQ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAPCD1Q5SSQ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAPCD1Q5SSQ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAPCD1Q5SSQ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAPCD1Q5SSQ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAPCD1Q5SSQ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAPCD1Q5SSQ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms