Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC38Q502W7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC38Q502W7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC38Q502W7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC38Q502W7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC38Q502W7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC38Q502W7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC38Q502W7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC38Q502W7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC38Q502W7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC38Q502W7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC38Q502W7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC38Q502W7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC38Q502W7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC38Q502W7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC38Q502W7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC38Q502W7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC38Q502W7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC38Q502W7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC38Q502W7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC38Q502W7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC38Q502W7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC38Q502W7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC38Q502W7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC38Q502W7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC38Q502W7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC38Q502W7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC38Q502W7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC38Q502W7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC38Q502W7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC38Q502W7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC38Q502W7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC38Q502W7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC38Q502W7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC38Q502W7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC38Q502W7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC38Q502W7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC38Q502W7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC38Q502W7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC38Q502W7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC38Q502W7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC38Q502W7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC38Q502W7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC38Q502W7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC38Q502W7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC38Q502W7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC38Q502W7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC38Q502W7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC38Q502W7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC38Q502W7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC38Q502W7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC38Q502W7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC38Q502W7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC38Q502W7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC38Q502W7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC38Q502W7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC38Q502W7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC38Q502W7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC38Q502W7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC38Q502W7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC38Q502W7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC38Q502W7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC38Q502W7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC38Q502W7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC38Q502W7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC38Q502W7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC38Q502W7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC38Q502W7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC38Q502W7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC38Q502W7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC38Q502W7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC38Q502W7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC38Q502W7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC38Q502W7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC38Q502W7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC38Q502W7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC38Q502W7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC38Q502W7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC38Q502W7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC38Q502W7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC38Q502W7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC38Q502W7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC38Q502W7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC38Q502W7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC38Q502W7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC38Q502W7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms