Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SKIV2LQ15477 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SKIV2LQ15477 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SKIV2LQ15477 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SKIV2LQ15477 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SKIV2LQ15477 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SKIV2LQ15477 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SKIV2LQ15477 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SKIV2LQ15477 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SKIV2LQ15477 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SKIV2LQ15477 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SKIV2LQ15477 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SKIV2LQ15477 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SKIV2LQ15477 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SKIV2LQ15477 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SKIV2LQ15477 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SKIV2LQ15477 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SKIV2LQ15477 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SKIV2LQ15477 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SKIV2LQ15477 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SKIV2LQ15477 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SKIV2LQ15477 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SKIV2LQ15477 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SKIV2LQ15477 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SKIV2LQ15477 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SKIV2LQ15477 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SKIV2LQ15477 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SKIV2LQ15477 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SKIV2LQ15477 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SKIV2LQ15477 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SKIV2LQ15477 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SKIV2LQ15477 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SKIV2LQ15477 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SKIV2LQ15477 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SKIV2LQ15477 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SKIV2LQ15477 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SKIV2LQ15477 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SKIV2LQ15477 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SKIV2LQ15477 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
SKIV2LQ15477 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SKIV2LQ15477 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SKIV2LQ15477 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SKIV2LQ15477 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SKIV2LQ15477 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SKIV2LQ15477 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SKIV2LQ15477 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SKIV2LQ15477 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SKIV2LQ15477 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SKIV2LQ15477 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SKIV2LQ15477 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SKIV2LQ15477 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SKIV2LQ15477 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SKIV2LQ15477 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SKIV2LQ15477 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SKIV2LQ15477 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SKIV2LQ15477 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SKIV2LQ15477 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SKIV2LQ15477 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SKIV2LQ15477 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKIV2LQ15477 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKIV2LQ15477 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SKIV2LQ15477 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SKIV2LQ15477 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SKIV2LQ15477 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SKIV2LQ15477 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SKIV2LQ15477 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SKIV2LQ15477 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SKIV2LQ15477 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SKIV2LQ15477 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SKIV2LQ15477 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SKIV2LQ15477 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SKIV2LQ15477 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SKIV2LQ15477 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SKIV2LQ15477 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SKIV2LQ15477 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SKIV2LQ15477 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SKIV2LQ15477 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SKIV2LQ15477 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SKIV2LQ15477 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SKIV2LQ15477 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SKIV2LQ15477 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SKIV2LQ15477 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SKIV2LQ15477 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SKIV2LQ15477 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SKIV2LQ15477 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SKIV2LQ15477 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SKIV2LQ15477 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKIV2LQ15477 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SKIV2LQ15477 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SKIV2LQ15477 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SKIV2LQ15477 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKIV2LQ15477 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKIV2LQ15477 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKIV2LQ15477 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKIV2LQ15477 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKIV2LQ15477 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKIV2LQ15477 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SKIV2LQ15477 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SKIV2LQ15477 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SKIV2LQ15477 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms