Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR6A1Q15406 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR6A1Q15406 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR6A1Q15406 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR6A1Q15406 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
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