Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIRBPQ14011 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIRBPQ14011 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIRBPQ14011 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIRBPQ14011 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIRBPQ14011 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIRBPQ14011 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIRBPQ14011 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIRBPQ14011 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIRBPQ14011 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIRBPQ14011 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIRBPQ14011 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIRBPQ14011 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIRBPQ14011 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIRBPQ14011 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIRBPQ14011 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CIRBPQ14011 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIRBPQ14011 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIRBPQ14011 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIRBPQ14011 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIRBPQ14011 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIRBPQ14011 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIRBPQ14011 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIRBPQ14011 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIRBPQ14011 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIRBPQ14011 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIRBPQ14011 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIRBPQ14011 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIRBPQ14011 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIRBPQ14011 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CIRBPQ14011 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIRBPQ14011 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIRBPQ14011 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIRBPQ14011 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIRBPQ14011 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIRBPQ14011 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIRBPQ14011 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIRBPQ14011 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIRBPQ14011 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIRBPQ14011 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIRBPQ14011 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIRBPQ14011 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIRBPQ14011 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CIRBPQ14011 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIRBPQ14011 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIRBPQ14011 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIRBPQ14011 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIRBPQ14011 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIRBPQ14011 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIRBPQ14011 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIRBPQ14011 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIRBPQ14011 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIRBPQ14011 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIRBPQ14011 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIRBPQ14011 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CIRBPQ14011 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CIRBPQ14011 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CIRBPQ14011 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CIRBPQ14011 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CIRBPQ14011 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIRBPQ14011 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIRBPQ14011 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIRBPQ14011 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIRBPQ14011 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIRBPQ14011 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIRBPQ14011 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIRBPQ14011 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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