Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.9■■■■■ 5.1
GRIN2AQ12879 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.87■■■■■ 5.09
GRIN2AQ12879 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
GRIN2AQ12879 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.86■■■■■ 5.09
GRIN2AQ12879 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
GRIN2AQ12879 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
GRIN2AQ12879 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
GRIN2AQ12879 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
GRIN2AQ12879 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
GRIN2AQ12879 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
GRIN2AQ12879 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
GRIN2AQ12879 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC46.69■■■■■ 5.06
GRIN2AQ12879 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
GRIN2AQ12879 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
GRIN2AQ12879 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
GRIN2AQ12879 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC46.63■■■■■ 5.06
GRIN2AQ12879 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC46.63■■■■■ 5.05
GRIN2AQ12879 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC46.62■■■■■ 5.05
GRIN2AQ12879 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC46.62■■■■■ 5.05
GRIN2AQ12879 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC46.61■■■■■ 5.05
GRIN2AQ12879 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
GRIN2AQ12879 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC46.59■■■■■ 5.05
GRIN2AQ12879 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.59■■■■■ 5.05
GRIN2AQ12879 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
GRIN2AQ12879 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.04
GRIN2AQ12879 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
GRIN2AQ12879 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
GRIN2AQ12879 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
GRIN2AQ12879 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC46.5■■■■■ 5.03
GRIN2AQ12879 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.47■■■■■ 5.03
GRIN2AQ12879 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
GRIN2AQ12879 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
GRIN2AQ12879 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
GRIN2AQ12879 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC46.4■■■■■ 5.02
GRIN2AQ12879 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC46.39■■■■■ 5.02
GRIN2AQ12879 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC46.39■■■■■ 5.02
GRIN2AQ12879 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC46.36■■■■■ 5.01
GRIN2AQ12879 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC46.31■■■■■ 5
GRIN2AQ12879 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC46.31■■■■■ 5
GRIN2AQ12879 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
GRIN2AQ12879 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
GRIN2AQ12879 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
GRIN2AQ12879 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
GRIN2AQ12879 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.23■■■■■ 4.99
GRIN2AQ12879 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.23■■■■■ 4.99
GRIN2AQ12879 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC46.21■■■■■ 4.99
GRIN2AQ12879 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC46.21■■■■■ 4.99
GRIN2AQ12879 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
GRIN2AQ12879 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC46.2■■■■■ 4.99
GRIN2AQ12879 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
GRIN2AQ12879 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
GRIN2AQ12879 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
GRIN2AQ12879 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC46.16■■■■■ 4.98
GRIN2AQ12879 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
GRIN2AQ12879 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
GRIN2AQ12879 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
GRIN2AQ12879 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC46.13■■■■■ 4.98
GRIN2AQ12879 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
GRIN2AQ12879 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
GRIN2AQ12879 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
GRIN2AQ12879 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
GRIN2AQ12879 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
GRIN2AQ12879 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
GRIN2AQ12879 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
GRIN2AQ12879 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC45.97■■■■■ 4.95
GRIN2AQ12879 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC45.97■■■■■ 4.95
GRIN2AQ12879 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
GRIN2AQ12879 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC45.94■■■■■ 4.95
GRIN2AQ12879 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.93■■■■■ 4.94
GRIN2AQ12879 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC45.93■■■■■ 4.94
GRIN2AQ12879 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
GRIN2AQ12879 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
GRIN2AQ12879 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
GRIN2AQ12879 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
GRIN2AQ12879 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC45.88■■■■■ 4.94
GRIN2AQ12879 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
GRIN2AQ12879 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC45.87■■■■■ 4.93
GRIN2AQ12879 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
GRIN2AQ12879 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
GRIN2AQ12879 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
GRIN2AQ12879 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC45.79■■■■■ 4.92
GRIN2AQ12879 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
GRIN2AQ12879 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.78■■■■■ 4.92
GRIN2AQ12879 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
GRIN2AQ12879 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
GRIN2AQ12879 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
GRIN2AQ12879 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
GRIN2AQ12879 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
GRIN2AQ12879 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
GRIN2AQ12879 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
GRIN2AQ12879 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.67■■■■■ 4.9
GRIN2AQ12879 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
GRIN2AQ12879 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
GRIN2AQ12879 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
GRIN2AQ12879 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
GRIN2AQ12879 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
GRIN2AQ12879 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
GRIN2AQ12879 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.61■■■■■ 4.89
GRIN2AQ12879 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
GRIN2AQ12879 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC45.6■■■■■ 4.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms