Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UBE3AQ05086 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
UBE3AQ05086 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UBE3AQ05086 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UBE3AQ05086 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
UBE3AQ05086 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBE3AQ05086 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBE3AQ05086 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBE3AQ05086 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBE3AQ05086 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBE3AQ05086 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBE3AQ05086 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UBE3AQ05086 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBE3AQ05086 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBE3AQ05086 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE3AQ05086 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBE3AQ05086 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBE3AQ05086 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3AQ05086 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3AQ05086 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3AQ05086 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3AQ05086 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3AQ05086 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE3AQ05086 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE3AQ05086 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE3AQ05086 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE3AQ05086 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE3AQ05086 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE3AQ05086 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE3AQ05086 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE3AQ05086 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE3AQ05086 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE3AQ05086 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE3AQ05086 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE3AQ05086 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE3AQ05086 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBE3AQ05086 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBE3AQ05086 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE3AQ05086 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE3AQ05086 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE3AQ05086 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE3AQ05086 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE3AQ05086 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE3AQ05086 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE3AQ05086 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE3AQ05086 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE3AQ05086 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE3AQ05086 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UBE3AQ05086 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBE3AQ05086 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBE3AQ05086 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBE3AQ05086 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
UBE3AQ05086 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBE3AQ05086 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBE3AQ05086 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE3AQ05086 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE3AQ05086 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE3AQ05086 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE3AQ05086 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBE3AQ05086 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE3AQ05086 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE3AQ05086 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE3AQ05086 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE3AQ05086 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE3AQ05086 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE3AQ05086 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE3AQ05086 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE3AQ05086 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBE3AQ05086 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBE3AQ05086 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBE3AQ05086 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBE3AQ05086 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE3AQ05086 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE3AQ05086 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBE3AQ05086 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBE3AQ05086 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE3AQ05086 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE3AQ05086 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE3AQ05086 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE3AQ05086 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE3AQ05086 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBE3AQ05086 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBE3AQ05086 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBE3AQ05086 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
UBE3AQ05086 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms