Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TFF2Q03403 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TFF2Q03403 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TFF2Q03403 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TFF2Q03403 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TFF2Q03403 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TFF2Q03403 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TFF2Q03403 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TFF2Q03403 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TFF2Q03403 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TFF2Q03403 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TFF2Q03403 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TFF2Q03403 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TFF2Q03403 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TFF2Q03403 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TFF2Q03403 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TFF2Q03403 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TFF2Q03403 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TFF2Q03403 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TFF2Q03403 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TFF2Q03403 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TFF2Q03403 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TFF2Q03403 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TFF2Q03403 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TFF2Q03403 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TFF2Q03403 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TFF2Q03403 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TFF2Q03403 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TFF2Q03403 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFF2Q03403 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFF2Q03403 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TFF2Q03403 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TFF2Q03403 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TFF2Q03403 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TFF2Q03403 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TFF2Q03403 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFF2Q03403 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFF2Q03403 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TFF2Q03403 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TFF2Q03403 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TFF2Q03403 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFF2Q03403 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFF2Q03403 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFF2Q03403 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TFF2Q03403 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TFF2Q03403 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TFF2Q03403 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TFF2Q03403 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TFF2Q03403 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TFF2Q03403 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TFF2Q03403 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TFF2Q03403 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TFF2Q03403 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TFF2Q03403 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TFF2Q03403 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TFF2Q03403 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TFF2Q03403 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TFF2Q03403 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TFF2Q03403 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TFF2Q03403 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TFF2Q03403 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TFF2Q03403 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TFF2Q03403 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TFF2Q03403 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TFF2Q03403 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TFF2Q03403 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TFF2Q03403 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TFF2Q03403 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TFF2Q03403 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TFF2Q03403 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TFF2Q03403 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TFF2Q03403 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TFF2Q03403 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TFF2Q03403 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TFF2Q03403 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TFF2Q03403 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TFF2Q03403 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TFF2Q03403 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TFF2Q03403 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TFF2Q03403 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TFF2Q03403 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TFF2Q03403 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TFF2Q03403 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TFF2Q03403 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TFF2Q03403 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TFF2Q03403 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFF2Q03403 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TFF2Q03403 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TFF2Q03403 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TFF2Q03403 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TFF2Q03403 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TFF2Q03403 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TFF2Q03403 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TFF2Q03403 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TFF2Q03403 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TFF2Q03403 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TFF2Q03403 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TFF2Q03403 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TFF2Q03403 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TFF2Q03403 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms