Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFITM3Q01628 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFITM3Q01628 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFITM3Q01628 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFITM3Q01628 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFITM3Q01628 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFITM3Q01628 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFITM3Q01628 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFITM3Q01628 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFITM3Q01628 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFITM3Q01628 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFITM3Q01628 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFITM3Q01628 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFITM3Q01628 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFITM3Q01628 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFITM3Q01628 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFITM3Q01628 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFITM3Q01628 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFITM3Q01628 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFITM3Q01628 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFITM3Q01628 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFITM3Q01628 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFITM3Q01628 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFITM3Q01628 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFITM3Q01628 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFITM3Q01628 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFITM3Q01628 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFITM3Q01628 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFITM3Q01628 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFITM3Q01628 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFITM3Q01628 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFITM3Q01628 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFITM3Q01628 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFITM3Q01628 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFITM3Q01628 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFITM3Q01628 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFITM3Q01628 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFITM3Q01628 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFITM3Q01628 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFITM3Q01628 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFITM3Q01628 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFITM3Q01628 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFITM3Q01628 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFITM3Q01628 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFITM3Q01628 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFITM3Q01628 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFITM3Q01628 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFITM3Q01628 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFITM3Q01628 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFITM3Q01628 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IFITM3Q01628 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFITM3Q01628 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFITM3Q01628 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFITM3Q01628 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFITM3Q01628 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFITM3Q01628 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFITM3Q01628 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFITM3Q01628 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFITM3Q01628 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFITM3Q01628 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFITM3Q01628 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFITM3Q01628 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFITM3Q01628 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFITM3Q01628 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFITM3Q01628 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFITM3Q01628 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFITM3Q01628 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms