Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GPC5P78333 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPC5P78333 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GPC5P78333 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPC5P78333 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPC5P78333 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPC5P78333 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPC5P78333 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GPC5P78333 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GPC5P78333 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPC5P78333 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPC5P78333 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPC5P78333 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPC5P78333 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPC5P78333 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPC5P78333 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPC5P78333 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPC5P78333 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPC5P78333 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPC5P78333 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPC5P78333 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPC5P78333 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GPC5P78333 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GPC5P78333 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GPC5P78333 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPC5P78333 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPC5P78333 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
GPC5P78333 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GPC5P78333 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GPC5P78333 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPC5P78333 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPC5P78333 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPC5P78333 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPC5P78333 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPC5P78333 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPC5P78333 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GPC5P78333 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPC5P78333 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPC5P78333 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPC5P78333 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPC5P78333 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPC5P78333 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPC5P78333 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPC5P78333 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GPC5P78333 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GPC5P78333 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GPC5P78333 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GPC5P78333 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GPC5P78333 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GPC5P78333 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPC5P78333 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPC5P78333 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPC5P78333 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPC5P78333 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPC5P78333 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPC5P78333 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPC5P78333 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPC5P78333 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GPC5P78333 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPC5P78333 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPC5P78333 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPC5P78333 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPC5P78333 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPC5P78333 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPC5P78333 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPC5P78333 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPC5P78333 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPC5P78333 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPC5P78333 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPC5P78333 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPC5P78333 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPC5P78333 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPC5P78333 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPC5P78333 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPC5P78333 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPC5P78333 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPC5P78333 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPC5P78333 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPC5P78333 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPC5P78333 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPC5P78333 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPC5P78333 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPC5P78333 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GPC5P78333 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPC5P78333 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPC5P78333 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPC5P78333 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPC5P78333 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPC5P78333 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GPC5P78333 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GPC5P78333 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPC5P78333 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GPC5P78333 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPC5P78333 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPC5P78333 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPC5P78333 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPC5P78333 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPC5P78333 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPC5P78333 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GPC5P78333 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms