Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPEP62304 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNRPEP62304 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNRPEP62304 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPEP62304 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPEP62304 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPEP62304 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPEP62304 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPEP62304 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPEP62304 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPEP62304 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNRPEP62304 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNRPEP62304 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPEP62304 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPEP62304 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPEP62304 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPEP62304 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPEP62304 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPEP62304 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPEP62304 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPEP62304 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPEP62304 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPEP62304 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPEP62304 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPEP62304 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPEP62304 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPEP62304 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPEP62304 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPEP62304 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPEP62304 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPEP62304 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPEP62304 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPEP62304 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPEP62304 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPEP62304 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPEP62304 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPEP62304 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPEP62304 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPEP62304 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPEP62304 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPEP62304 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPEP62304 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPEP62304 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPEP62304 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPEP62304 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPEP62304 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPEP62304 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPEP62304 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPEP62304 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPEP62304 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPEP62304 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPEP62304 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPEP62304 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPEP62304 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPEP62304 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPEP62304 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPEP62304 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPEP62304 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPEP62304 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPEP62304 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPEP62304 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPEP62304 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPEP62304 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPEP62304 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPEP62304 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPEP62304 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPEP62304 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPEP62304 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPEP62304 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPEP62304 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPEP62304 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPEP62304 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNRPEP62304 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPEP62304 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPEP62304 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPEP62304 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPEP62304 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPEP62304 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPEP62304 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPEP62304 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPEP62304 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPEP62304 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPEP62304 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPEP62304 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPEP62304 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPEP62304 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPEP62304 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms