Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ROMO1P60602 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ROMO1P60602 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ROMO1P60602 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ROMO1P60602 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ROMO1P60602 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ROMO1P60602 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ROMO1P60602 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ROMO1P60602 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ROMO1P60602 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ROMO1P60602 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms